[发明专利]一种淫羊藿ISSR-PCR分子标记方法在审
申请号: | 201811046039.1 | 申请日: | 2018-09-07 |
公开(公告)号: | CN109055595A | 公开(公告)日: | 2018-12-21 |
发明(设计)人: | 段媛媛;郭杰;游景茂;周武先;郭晓亮;卢超 | 申请(专利权)人: | 湖北省农业科学院中药材研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 夏艳 |
地址: | 445000 湖北省*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 淫羊藿 分子标记 引物 遗传多样性分析 扩增条带 良种选育 多态性 扩增 嫩叶 节约 清晰 应用 优化 | ||
1.一种淫羊藿ISSR-PCR分子标记方法,其特征在于,具体包括以下步骤:
步骤1,采集淫羊藿的嫩叶,提取植物组DNA;
步骤2,采用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性;
步骤3,采用引物及ISSR-PCR反应体系对步骤1提取的DNA样品进行扩增。
2.如权利要求1所述的淫羊藿ISSR-PCR分子标记方法,其特征在于,步骤3中ISSR-PCR反应体系为:20μL的反应体系中含有2×Taq Master Mix 9.8μL,模板DNA 30ng,引物0.325μM。
3.如权利要求1或2所述的淫羊藿ISSR-PCR分子标记方法,其特征在于,步骤3中ISSR-PCR扩增程序为:94℃预变性4min,94℃变性1min,46.8~65℃退火40s,72℃延伸40s,循环40次,72℃再延伸5min,4℃保存。
4.如权利要求3所述的淫羊藿ISSR-PCR分子标记方法,其特征在于,步骤3中引物为:
UBC808,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.1;
或UBC814,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.2;
或UBC826,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.3;
或UBC827,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.4;
或UBC840,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.5;
或UBC846,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.6;
或UBC856,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.7。
5.如权利要求4所述的淫羊藿ISSR-PCR分子标记方法,其特征在于,步骤3中引物在ISSR-PCR扩增中优化后的退火温度,具体如下:UBC808 60.3℃;UBC814 46.8℃;UBC82660.3℃;UBC827 65℃;UBC840 52.4℃;UBC846 54.3℃;UBC856 54.3℃。
6.一种引物,其特征在于,所述引物用于标记淫羊藿ISSR-PCR分子,所述引物为:
UBC808,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.1;
或UBC814,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.2;
或UBC826,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.3;
或UBC827,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.4;
或UBC840,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.5;
或UBC846,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.6;
或UBC856,其核苷酸序列为:SEQ ID NO.7。
7.如权利要求6所述的引物,其特征在于,所述引物在ISSR-PCR扩增中优化后的退火温度,具体如下:UBC808 60.3℃;UBC814 46.8℃;UBC826 60.3℃;UBC827 65℃;UBC840 52.4℃;UBC846 54.3℃;UBC856 54.3℃。
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