[发明专利]一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法有效

专利信息
申请号: 201811029387.8 申请日: 2018-09-05
公开(公告)号: CN109182598B 公开(公告)日: 2021-09-24
发明(设计)人: 王莹;何茂华 申请(专利权)人: 临沂大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6816
代理公司: 北京栈桥知识产权代理事务所(普通合伙) 11670 代理人: 刘亚娟
地址: 276000 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 tdt dnazyme 扩增 黄瓜 斑驳 病毒 可视化 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种基于脱氧核苷酸末端转移酶TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)将T1和P1混合在NEB CutSmart缓冲溶液中,在37℃下杂交;

(2)加入内切酶AcⅡ,利用AcⅡ识别5′-AACGTT-3′位点,在37℃下持续反应一定时间,获得酶切产物,37℃下解链为4个ssDNA片段;

(3)取一定量的所述酶切产物,加入TdT和dCTP于磷酸盐缓冲溶液中混合,在37℃下进行加尾反应,升温至85℃灭活3min,获得Mg2+-依赖的DNAzyme的完整酶序列;

(4)加入HP和含Mg2+缓冲液,在37℃下孵育100min,Mg2+-依赖的DNAzyme的完整酶序列与HP进行杂交,在Mg2+存在下,Mg2+-依赖的DNAzyme剪切HP的识别位点,将HP剪切为两部分;

(5)加入一定浓度的Hemin和含K+缓冲液,在37℃下孵育30min,形成Hemin/G-四连体结构溶液;

(6)最后依次在Hemin/G-四连体结构溶液中加入一定浓度的ABTS2-和H2O2溶液,室温下反应一段时间,得到绿色溶液;

所述T1的基因序列如SEQ ID No.1所示,P1的基因序列如SEQ ID No.2所示,HP的基因序列如SEQ ID No.3所示,SEQ ID No.1:AACCCGAACGTTTG,SEQ ID No.2:ACACACAGCGATCACCCATGTTAAACGTTCGGGTT,SEQ ID No.3:TTTTGGGTTGGGCGGGATGGGTTTATrAGGTGTGTATCCCGCCC;

步骤(1)中所述P1浓度为1.0μM;

步骤(4)中所述HP浓度为1.0μM;

步骤(2)中所述AcⅡ的酶切反应时间为50min;

步骤(3)中所述加尾反应时间为30min;

步骤(4)中所述Mg2+-依赖的DNAzyme和HP的杂交时间为100min。

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