[发明专利]基于染色质重塑激活内源性Pdx1基因表达的方法有效
申请号: | 201810947480.0 | 申请日: | 2018-08-20 |
公开(公告)号: | CN109097400B | 公开(公告)日: | 2022-01-04 |
发明(设计)人: | 王启伟;叶华虎 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | C12N15/867 | 分类号: | C12N15/867;C12N5/10;C12N5/071 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;张立娜 |
地址: | 100071*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 染色质 重塑 激活 内源 pdx1 基因 表达 方法 | ||
1.一种激活靶细胞中内源性Pdx1基因表达的方法,是基于CRISPR-on的SAM系统建立激活靶细胞中内源性Pdx1基因表达的方法;
所述SAM系统包括靶向Pdx1基因转录起始点上游-400至+1 bp位置的sgRNA;所述sgRNA的靶序列为SEQ ID No.3和SEQ ID No.4。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:使所述靶细胞表达dCAS-VP64融合蛋白、MS2-P65-HSF1融合蛋白和所述sgRNA,从而激活所述靶细胞中内源性Pdx1基因表达。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:
(1)包装能够表达所述dCAS-VP64融合蛋白的重组慢病毒A;包装能够表达所述MS2-P65-HSF1融合蛋白的重组慢病毒B;然后将所述重组慢病毒A和所述重组慢病毒B一起感染所述靶细胞,得到阳性细胞系;
(2)向步骤(1)所得阳性细胞系中导入能够表达所述sgRNA的载体,进而实现激活所述靶细胞中内源性Pdx1基因表达。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(1)中,包装所述重组慢病毒A时,采用的目的质粒是lenti dCAS-VP64_Blast载体;包装所述重组慢病毒B时,采用的目的质粒是MS2-P65-HSF1_Hygro 载体。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(1)中,包装所述重组慢病毒A和所述重组慢病毒B时,采用的包装细胞均为293T细胞。
6.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,能够表达所述sgRNA的载体为载体A和载体B;
所述载体A为将通过BsmB I酶切位点向lenti sgRNA(MS2)_zeo backbone中插入SEQID No.3所示DNA片段后得到的重组载体;所述载体B为将通过BsmB I酶切位点向lentisgRNA(MS2)_zeo backbone中插入SEQ ID No.4所示DNA片段后得到的重组载体。
7.根据权利要求1-6中任一所述的方法,其特征在于:所述靶细胞为293T细胞或多能干细胞。
8.一种制备内源性Pdx1基因表达被激活的细胞的方法,包括如下步骤:利用权利要求1-7中任一所述的方法制备得到内源性Pdx1基因表达被激活的细胞。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于:所述细胞为293T细胞或多能干细胞。
10.sgRNA,为靶向Pdx1基因转录起始点上游-400至+1 bp位置的sgRNA;所述sgRNA的靶序列为SEQ ID No.3和SEQ ID No.4。
11.能够表达权利要求10所述sgRNA的载体。
12.根据权利要求11所述的载体,其特征在于:所述载体由载体A和载体B组成;
所述载体A为将通过BsmB I酶切位点向lenti sgRNA(MS2)_zeo backbone中插入SEQID No.3所示DNA片段后得到的重组载体;所述载体B为将通过BsmB I酶切位点向lentisgRNA(MS2)_zeo backbone中插入SEQ ID No.4所示DNA片段后得到的重组载体。
13.成套载体,由权利要求11或12所述的载体、lenti dCAS-VP64_Blast载体、MS2-P65-HSF1_Hygro 载体组成。
14.权利要求1-7中任一所述的方法在诱导多能干细胞定向分化为胰岛β细胞中的应用。
15.权利要求1-7中任一所述的方法在促进胰腺胚胎发育中的应用。
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