[发明专利]检测鸡CDKN3基因启动子区indel复等位基因标记的引物、试剂盒及其应用

权利要求书

1.一种鸡CDKN3基因启动子区indel复等位基因标记的检测试剂在预测鸡群生长状况方面的应用，其特征在于，所述鸡CDKN3基因的NCBI GenBank登录号为NC_006092.5，所述indel复等位基因标记为SEQ ID NO.1所示的5’端起第140-141位和/或第159-160位插入或缺失，5’端起第140-141位插入核苷酸序列后的序列如SEQ ID NO.2所示，5’端起第159-160位插入核苷酸序列后的序列如SEQ ID NO.3所示；所述鸡群生长状况是指鸡体重、胫长、半净膛重、全净膛重及屠体重中的至少一种；C³C³是CDKN3基因启动子区无片段插入的基因型，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；C⁴C⁴是CDKN3基因启动子区有一段20bp片段插入的基因型，核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；C⁵C⁵是CDKN3基因启动子区有两段19bp片段插入的基因型，核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，其中C³C³基因型为GenBank NC_006092.5中的序列；通过上述的C⁵C⁵、C⁴C⁴、C³C³三种基因型自由组合可以得到C⁵C⁵基因型、C⁴C⁴基因型、C³C³基因型、C⁴C⁵基因型、C³C⁴基因型、C³C⁵基因型六种基因型的鸡个体；生长状况良好的基因型为C³C³、C⁴C⁴、C³C⁴的个体。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：包括如下步骤：

（1）判定待测鸡CDKN3基因启动子区indel复等位基因的基因型；

（2）根据判定鸡基因型的结果预测鸡群生长状况；

步骤（1）判定待测鸡CDKN3基因启动子区indel复等位基因的基因型包括如下步骤：

①提取待测鸡的基因组DNA，利用检测鸡CDKN3基因启动子区indel复等位基因标记的引物进行PCR扩增，所述引物的序列为：

P-F:5′-GACAGTAAGCTAGTGTAACCA-3′；

P-R:5′-TTCTGTGATTCTGTGACAAGG-3′；

②对PCR扩增产物进行测序；

③根据测序结果判定待测鸡的基因型，基因型的判定方法如下：若有257bp的片段，则该待测鸡为C⁵C⁵基因型，个体为纯合体；若扩增片段大小为238bp，则该待测鸡为C⁴C⁴基因型，个体为纯合体；若扩增片段大小为219bp，则该待测鸡为C³C³基因型，个体为纯合体；若扩增片段大小为257bp和238bp，则该待测鸡为C⁴C⁵基因型，个体为杂合体；若扩增片段大小为238bp和219bp，则该待测鸡为C³C⁴基因型，个体为杂合体；若扩增片段大小为219bp和257bp，则该待测鸡为C³C⁵基因型，个体为杂合体。