[发明专利]碱基识别方法及装置、生成彩色图像的方法及系统

说明书

一种碱基识别方法及装置、生成彩色图像的方法及系统、计算机设备和计算机存储介质，一个实施例中的方法包括：获取彩色碱基图像，所述彩色碱基图像通过采集携带荧光标记的碱基发射出的光学信号，并对采集的光学信号进行彩色成像获得；对所述彩色碱基图像进行碱基识别，获得碱基识别结果。本实施例方案无需复杂的光学硬件系统，就可以实现对碱基的识别，简化了识别方案且该提高了效率。

技术领域

本申请涉及分子生物学、光学以及计算科学技术领域，尤其涉及核酸检测技术领域，特别是涉及一种碱基识别方法、一种碱基识别装置、一种生成彩色图像的方法、一种生成彩色图像的系统、一种计算机设备和一种计算机存储介质。

背景技术

碱基识别是高通量基因测序的核心环节，它主要是指从含有碱基信息的荧光点图中获得基因序列信息。现有技术普遍采用多个单色相机配合其特定的分光棱镜采集荧光信号，主要通过判定单色图像中不同荧光点的强度来识别碱基。然而目前的碱基识别方式复杂且效率较低。

发明内容

基于此，有必要针对上述技术问题，提供一种碱基识别方法及装置、生成彩色图像的方法及系统、计算机设备和计算机存储介质。

一种碱基识别方法，所述方法包括：

获取彩色碱基图像，所述彩色碱基图像通过采集携带荧光标记的碱基发射出的光学信号，并对采集的光学信号进行彩色成像获得；

对所述彩色碱基图像进行碱基识别，获得碱基识别结果。

一个实施例中，对彩色碱基图像进行碱基识别，获得碱基识别结果，包括：确定所述彩色碱基图像的各光点的第一光点颜色信息；基于各光点的第一光点颜色信息，确定各碱基类别对应的第一参考颜色信息；基于各光点的第一光点颜色信息和各碱基类别对应的第一参考颜色信息，确定第一碱基识别结果，所述第一碱基识别结果包括所述彩色碱基图像中的光点所属的碱基类别。

一个实施例中，确定所述彩色碱基图像的各光点的第一光点颜色信息，包括：确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息，所述光点位置信息包括光点中心像素；基于各光点的光点中心像素，以及该光点中心像素的邻域像素，确定各光点的第一光点颜色信息。

一个实施例中，确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息，包括：检测所述彩色碱基图像中的各光点的图像边缘，并确定图像边缘的曲率半径；基于各光点的图像边缘，确定各光点的光点中心像素的位置坐标，所述光点位置信息包括所述图像边缘的曲率半径以及所述光点中心像素的位置坐标。

一个实施例中，确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息，还包括：在检测所述彩色碱基图像中的各光点的图像边缘之前，对所述彩色碱基图像进行图像锐化处理。

一个实施例中，确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息之前，还包括步骤：对预定列数的各小区的图像进行图像拼接，获得预定列数全景图像；

此时，确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息，包括：确定所述预定列数全景图像中的各光点的光点位置信息。

一个实施例中的所述预定列数为一条泳道对应的列数。

一个实施例中，基于各光点的光点中心像素，以及该光点中心像素的邻域像素，确定各光点的第一光点颜色信息，包括：任意一个光点的第一光点颜色信息，为该光点的光点中心像素以及该光点中心像素的N邻域像素的颜色信息的平均值，所述颜色信息包括RGB值和强度值。

一个实施例中，确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息之后，还包括步骤：在识别出的光点中心像素的周围绘制预定图形。

一个实施例中，还包括步骤：将确定的各光点的光点位置信息进行存储。