[发明专利]碱基识别方法及装置、生成彩色图像的方法及系统有效
| 申请号: | 201810939942.4 | 申请日: | 2018-08-17 |
| 公开(公告)号: | CN109117796B | 公开(公告)日: | 2021-01-08 |
| 发明(设计)人: | J奥维利.亚当斯;张必良;李俞锋;邬捷豪 | 申请(专利权)人: | 广州市锐博生物科技有限公司 |
| 主分类号: | G06K9/00 | 分类号: | G06K9/00;G06K9/20 |
| 代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 黄晓庆 |
| 地址: | 510663 广东省广州市广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 碱基 识别 方法 装置 生成 彩色 图像 系统 | ||
1.一种碱基识别方法,所述方法包括:
获取彩色碱基图像,所述彩色碱基图像通过一个彩色相机采集携带荧光标记的碱基在激光光源生成的混合波长激光光束的照射下发射出的光学信号,并对采集的光学信号进行彩色成像获得;所述彩色碱基图像中的每个像素包括以下四个特征:红色值、绿色值、蓝色值和强度值,所述强度值基于所述红色值、所述绿色值和所述蓝色值计算获得;所述激光光源包括:第一单色激光器、第二单色激光器和第三单色激光器,分别与所述第一单色激光器、所述第二单色激光器和所述第三单色激光器对应的第一聚焦镜、第二聚焦镜和第三聚焦镜,第一反射镜,第一合光镜,第二反射镜,第二合光镜以及混合波长聚焦镜;所述第一单色激光器、所述第二单色激光器、所述第三单色激光器分别发出465nm蓝色激光、532nm绿色激光和660nm红色激光,所述第一合光镜为反红透绿合光镜,所述第二合光镜为反蓝透绿透红合光镜;所述第一单色激光器发出的蓝色激光经所述第一聚焦镜会聚、并经所述第一反射镜反射之后,通过所述反蓝透绿透红合光镜;所述第二单色激光器发出的绿色激光经所述第二聚焦镜会聚后,通过所述反红透绿合光镜与所述反蓝透绿透红合光镜;所述第三单色激光器发出的红色激光经所述第三聚焦镜会聚、并经所述第二反射镜反射之后,通过所述反红透绿合光镜和所述反蓝透绿透红合光镜;三种波长的单色激光通过所述反蓝透绿透红合光镜之后,合成一束初始混合波长激光光束,所述初始混合波长激光光束经所述混合波长聚焦镜聚焦后,获得所述混合波长激光光束;
对所述彩色碱基图像进行碱基识别,获得碱基识别结果;
对所述彩色碱基图像进行碱基识别,获得碱基识别结果,包括:
确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息,所述光点位置信息包括光点中心像素,基于各光点的光点中心像素以及该光点中心像素的邻域像素的颜色信息的平均值,确定各光点的第一光点颜色信息,所述颜色信息包括红色值、绿色值、蓝色值和强度值;
确定主窗口内的预定数目个光点,所述预定数目个光点的第一光点颜色信息之间的差值在指定范围内,将所述预定数目个光点的第一光点颜色信息的平均值,确定为相应碱基类别对应的第一参考颜色信息;
基于各光点的第一光点颜色信息和各碱基类别对应的第一参考颜色信息,确定第一碱基识别结果,所述第一碱基识别结果包括所述彩色碱基图像中的光点所属的碱基类别。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,包括下述各项中的至少一项:
第一项:
基于各光点的第一光点颜色信息和各碱基类别对应的第一参考颜色信息,确定第一碱基识别结果,包括:
将光点的第一光点颜色信息和各碱基类别对应的第一参考颜色信息进行第一比对分析,获得第一比对分析结果;
基于第一比对分析结果,确定该光点所属的碱基类别,获得第一碱基识别结果;
第二项:
在确定第一碱基识别结果之后,还包括步骤:
确定各第一碱基识别结果的准确率。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,包括下述各项中的至少一项:
第一项:
确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息,包括:
检测所述彩色碱基图像中的各光点的图像边缘,并确定图像边缘的曲率半径;
基于各光点的图像边缘,确定各光点的光点中心像素的位置坐标,所述光点位置信息包括光点的所述图像边缘的曲率半径以及所述光点中心像素的位置坐标;
第二项:
确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息之前,还包括步骤:对预定列数的各小区的图像进行图像拼接,获得预定列数全景图像;
确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息,包括:确定所述预定列数全景图像中的各光点的光点位置信息;
第三项:
确定所述彩色碱基图像的各光点的光点位置信息之后,还包括步骤:
在识别出的光点中心像素的周围绘制预定图形;
第四项:
还包括步骤:将确定的各光点的光点位置信息进行存储。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,确定各第一碱基识别结果的准确率,包括:
确定各第一碱基识别结果的第一质量分数,基于所述第一质量分数确定所述第一碱基识别结果的准确率,所述第一质量分数与准确率正相关。
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