[发明专利]一种KIR2DL2 mRNA的荧光定量PCR检测方法及其检测试剂盒在审
申请号: | 201810938969.1 | 申请日: | 2018-08-17 |
公开(公告)号: | CN108949963A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
发明(设计)人: | 何军;李颖;邱桥成 | 申请(专利权)人: | 苏州大学附属第一医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 尹红红 |
地址: | 215000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 探针 引物 荧光定量PCR检测 基因序列 检测试剂 阳性DNA 特征性 生物检测领域 引物设计软件 特异性DNA 电泳 割胶 基因分型 基因检测 质粒测序 准确率 比对 测序 菌群 条带 样本 抽取 数据库 筛选 转化 | ||
1.荧光定量PCR检测KIR2DL2 mRNA的引物和探针,其特征在于,其序列为:
2DL2F:5’- AGAAACCTTCTCTCTCAGCCC -3’;
2DL2R:5’- GCCCTGCAGAGAACCTACA -3’;
荧光探针:5’- TCCTGCAGCTCCCGG -3’。
2.根据权利要求1所述的荧光定量PCR检测KIR2DL2 mRNA的引物和探针,其特征在于,获取所述的引物和探针的方法,包括以下步骤:
(1)抽提正常人DNA样本,运用PCR-SSOP方法进行KIR基因分型,筛选出KIR2DL2阳性的正常人DNA样本;
(2)将筛选出的DNA样本采用市售KIR2DL2序列特异性引物扩增板进行PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳;
(3)提取KIR2DL2特异性条带中的PCR产物,经割胶、纯化后,与T载体进行连接,转化受体是TOP10感受态耐链霉素的大肠杆菌,挑选菌群后,抽取质粒,使用ABI 3730XL型测序仪进行测序;
(4)测序结果与KIR/IPD数据库进行比对,证实其为特征性KIR2DL2基因序列,测序获得的具体序列为:
5’-AGAAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCACGGTTCTGGCAGGAGAGAGCGT
GACCTTGTCCTGCAGCTCCCGGAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAGGGGG
AGGCCCATGAATGTAGGTTCTCTGCAGGGC-3’;
(5)根据特征性KIR2DL2基因序列,运用引物设计软件,设计出如权利要求1所述的引物和探针。
3.根据权利要求2所述的荧光定量PCR检测KIR2DL2 mRNA的引物和探针,其特征在于,PCR扩增采用的仪器为Perkin Elmer GeneAmp 9700 PCR扩增仪。
4.根据权利要求2所述的荧光定量PCR检测KIR2DL2 mRNA的引物和探针,其特征在于,所述步骤(3)中使用的T载体为pMD18-T Vector。
5.根据权利要求2所述的荧光定量PCR检测KIR2DL2 mRNA的引物和探针,其特征在于,所述的引物和探针通过primerexpress软件进行设计。
6.权利要求1所述的荧光定量PCR检测KIR2DL2 mRNA的引物和探针在制备KIR2DL2mRNA荧光定量PCR检测试剂盒中的用途。
7.如权利要求6所述的用途,其特征在于,检测KIR2DL2 mRNA的方法包括以下步骤:
(1)提取总RNA;
(2)将RNA逆转录为cDNA;
(3)使用权利要求1中的引物和探针,运用荧光定量PCR通用体系,检测KIR2DL2的mRNA转录水平。
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