[发明专利]与黄瓜单性结实基因紧密连锁的InDel标记及其应用与引物在审

专利信息
申请号: 201810911614.3 申请日: 2018-08-12
公开(公告)号: CN108929916A 公开(公告)日: 2018-12-04
发明(设计)人: 陈学好;何梦晓;许学文;齐晓花;徐强 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 扬州苏中专利事务所(普通合伙) 32222 代理人: 沈志海
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 黄瓜 单性结实基因 单性结实 紧密连锁 引物 基因工程技术 黄瓜基因型 群体遗传学 品种鉴定 品种选育 设计引物 基因型 检测 染色体 测序 组学 应用 强弱 进程
【权利要求书】:

1.与黄瓜单性结实基因紧密连锁的InDel标记,将InDel标记命名为Chr7InDel01;Chr7InDel01位于黄瓜第7号染色体4,108,811处,在双亲的Chr7InDel01处,父本即弱单性结实性黄瓜品系有插入如下碱基:AAAATATTTACCAAAATTT,而母本即强单性结实性黄瓜品系在此处的碱基仅为A。

2.一组用于检测权利要求1所述与黄瓜单性结实基因相关的InDel标记的引物对,其碱基序列为:

上游引物5′-TGTTGTTGTTGCTATATGGGTAATG-3′,

反向引物5′-CGATAATGACGTGGGTTGTG-3′。

3.权利要求1所述的Chr7InDel01在黄瓜强/弱单性结实性品种鉴定中的应用:Chr7InDel01位于黄瓜第7号染色体4,108,811处;

若在Chr7InDel01处有插入碱基‘AAAATATTTACCAAAATTT’的黄瓜品种,为弱单性结实性品种;

若在Chr7InDel01处碱基仅为A的黄瓜品种,则为弱单性结实性品种。

4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:

(1)提取待检测黄瓜基因组DNA;

(2)以待检测黄瓜基因组DNA为模板,利用权利要求2所述引物对,进行PCR扩增反应,(3)经上述PCR扩增后进行电泳检测,如条带与父本‘ZK’一致,则为弱单性结实性黄瓜品系;如条带与母本‘BY’一致,则为强单性结实性黄瓜品系。

5.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增反应体系共10微升:1微升10 ×上样缓冲液loading buffer,0.2微升dNTP,0.5微升上游引物,0.5 微升下游引物,0.1微升rTaq酶,6.7微升ddH2O,1微升DNA。

6.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述PCR反应程序为:95℃预变性3min;94℃变性45s,68-58℃退火1min,每个循环降低2℃,72℃延伸1min,共6个循环;94℃变性30s,58-50℃退火1min,每个循环降低1℃,72℃延伸1min,共8个循环;72℃延伸1min;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸1min,共20个循环;72℃延伸7min;4℃保存。

7.权利要求1所述的InDel及衍生的引物在黄瓜单性结实分子标记辅助育种中的应用。

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