[发明专利]一种用于检测腐皮镰刀菌的核苷酸序列组、试剂盒及方法在审
| 申请号: | 201810701043.0 | 申请日: | 2018-06-29 |
| 公开(公告)号: | CN108841985A | 公开(公告)日: | 2018-11-20 |
| 发明(设计)人: | 车团结;徐红;李琳;沈颂东;曲静;李亚鹏 | 申请(专利权)人: | 苏州百源基因技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 广州市越秀区哲力专利商标事务所(普通合伙) 44288 | 代理人: | 胡拥军;糜婧 |
| 地址: | 215000 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 腐皮镰刀菌 核苷酸序列 对引物 试剂盒 操作便利性 高度保守 菌种分离 镰刀菌属 上游引物 下游引物 荧光探针 灵敏性 检测 扩增 | ||
1.一种用于检测腐皮镰刀菌的核苷酸序列组,其特征在于,包括以SEQ ID No.2所示的上游引物和SEQ ID No.3所示的下游引物。
2.如权利要求1所述的用于检测腐皮镰刀菌的核苷酸序列组,其特征在于,还包括如序列表SEQ ID No.4所示的探针,所述探针为荧光标记探针。
3.如权利要求2所述的用于检测腐皮镰刀菌的核苷酸序列组,其特征在于,所述探针的5’端标记的荧光报告基团为FAM,3’端标记的荧光淬灭基团为BHQ。
4.一种用于检测腐皮镰刀菌的试剂盒,其特征在于,包括如SEQ ID No.2所示的上游引物和SEQ ID No.3所示的下游引物和如序列表SEQ ID No.4所示的探针。
5.如权利要求4所述的检测腐皮镰刀菌的试剂盒,其特征在于,所述探针的5’端标记的荧光报告基团为FAM,3’端标记的荧光淬灭基团为BHQ。
6.如权利要求4所述的检测腐皮镰刀菌的试剂盒,其特征在于,还包括阳性质粒的标准品,所述阳性质粒的标准品是以腐皮镰刀菌的DNA为模版、经过如SEQ ID No.2所示的上游引物和SEQ ID No.3所示的下游引物PCR扩增回收,与pMD18-T质粒进行连接、转染后得到的。
7.一种用于检测腐皮镰刀菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)获得阳性质粒的标准品:以腐皮镰刀菌的DNA为模版、经过如SEQ ID No.2所示的上游引物和SEQ ID No.3所示的下游引物PCR扩增回收,与pMD18-T质粒进行连接、转染后得到阳性质粒的标准品;
2)PCR鉴定:分别以待测样品的DNA、阳性质粒的标准品为模板,以ddH2O为阴性对照,通过如SEQ ID No.2所示的上游引物和SEQ ID No.3所示的下游引物进行PCR反应检验。
8.如权利要求7所述的用于检测腐皮镰刀菌的方法,其特征在于,步骤2)中,PCR反应体系为:10×PCR buffer 2.5μL、dNTP(2.5μM)0.5μL、上游引物(1μM)0.5μL、下游引物(1μM)0.5μL、模板0.5μL、Taq酶(5U)0.5μL和ddH2O补足25μL;
PCR反应条件为:94℃预变性5min;94℃30s、50℃30s、72℃1min,30个循环;72℃10min。
9.如权利要求7所述的用于检测腐皮镰刀菌的方法,其特征在于,步骤2)中,PCR扩增体系包括如序列表SEQ ID No.4所示的探针。
10.如权利要求7所述的用于检测腐皮镰刀菌的方法,其特征在于,PCR反应体系:2×premix 10μL、上游引物(10μM)0.2μL、下游引物(10μM)0.2μL、探针(10μM)0.2μL、模板0.3μL、ddH2O补足至20μL;
PCR反应条件:94℃预变性2分钟,94℃10秒、60℃30s并收集荧光信号,40个循环。
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