[发明专利]胃肠癌的增生标签及预后在审
申请号: | 201810695737.8 | 申请日: | 2008-10-06 |
公开(公告)号: | CN108753975A | 公开(公告)日: | 2018-11-06 |
发明(设计)人: | A·安若姆肖阿;A·E·里夫;Y-H·林;M·A·布莱克 | 申请(专利权)人: | 环太平洋生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人: | 凌立;黄革生 |
地址: | 新西兰*** | 国省代码: | 新西兰;NZ |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 癌症 预后 结直肠癌 胃肠癌 胃癌 标签 个体化基因组学谱 遗传标志物 多个方面 患者治疗 细胞增生 试剂盒 预测 增生 存活 制作 | ||
1.试剂在制备用于预测不具有胃肠癌复发的胃肠癌患者长期存活的可能性的试剂盒中的用途,其中所述试剂用于测定获自患者的胃肠道样品中的一种或者多种基因的表达水平,所述一种或者多种基因中的一种是增殖细胞核抗原(PCNA)。
2.根据权利要求1所述的用途,其中一种或者多种基因增加的表达指示了不具有胃肠癌复发的长期存活可能性的增加。
3.根据权利要求1所述的用途,其中预测模型被应用于建立不具有胃肠癌复发的长期存活可能性,所述模型通过对复发和非复发肿瘤样品中预测标签的表达水平应用预测用途而建立。
4.根据权利要求3所述的用途,其中所述预测方法选自线性模型、支持向量机、神经网络、分类回归树、集成学习方法、线性判别分析、近邻方法、贝叶斯网络和独立成分分析。
5.根据权利要求1所述的用途,其中胃肠癌是胃癌或结直肠癌。
6.根据权利要求1所述的用途,其中从患者的固定的蜡包埋的胃肠癌组织样本分离RNA。
7.根据权利要求1所述的用途,其中从核芯针活检组织或细针抽吸细胞分离RNA。
8.试剂在制备用于预测诊断为患有胃肠癌的患者无胃肠癌复发的长期存活可能性的工具中的用途,其中所述试剂用于测定获自诊断为患有胃肠癌的患者的胃肠道样品中的一种或者多种基因的表达水平,所述基因包含RFC4。
9.根据权利要求8的用途,其中通过使用Cox比例风险模型进行统计分析。
10.根据权利要求8所述的用途,其中从固定的石蜡包埋的活检样品获取胃肠组织。
11.根据权利要求8所述的用途,其中所述工具还被用于预测患者长期存活的可能性。
12.根据权利要求8所述的用途,其中所述工具还被用于建议患者治疗模式。
13.试剂在制备用于预后的工具中的用途,其中所述试剂用于测定获自患者的胃肠道样品中的一种或者多种基因的表达水平,所述基因包含RFC4。
14.根据权利要求13所述的用途,其中将基因的RNA转录物水平相对于两种或更多种持家基因的平均RNA转录物进行标准化。
15.根据权利要求14所述的用途,其中持家基因是编码选自以下蛋白质的基因:甘油醛-3-磷酸-脱氢酶(GAPDH)、CypI、清蛋白、肌动蛋白、微管蛋白、亲环蛋白次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(HRPT)、L32和28S。
16.根据权利要求13所述的用途,其中基因的RNA转录物水平相对于所有测试的基因或其子集的平均RNA转录物或产物信号进行标准化。
17.根据权利要求13所述的用途,其中利用定量RT-PCR测定RNA转录物水平,且信号是Ct值。
18.根据权利要求13所述的用途,其中患者是人。
19.根据权利要求13所述的用途,其中样品是固定的石蜡包埋组织(FPET)样品或新鲜或冷冻的组织样品。
20.根据权利要求13所述的用途,其中样品是来源于细针活检、核芯针活检或其他类型活检的组织样品。
21.根据权利要求13所述的用途,其中利用定量RT-PCR进行定量分析。
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