[发明专利]一种单细胞测序筛选成纤维细胞标记分子的方法在审
| 申请号: | 201810691766.7 | 申请日: | 2018-06-28 |
| 公开(公告)号: | CN109112192A | 公开(公告)日: | 2019-01-01 |
| 发明(设计)人: | 赵永祥;薛志刚;钟莉娉;阳诺;何坚 | 申请(专利权)人: | 广西医科大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 韦肖燕 |
| 地址: | 530001 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 成纤维细胞 标记分子 测序 构建 肿瘤 生物信息学分析 筛选 高通量测序 测序文库 产物纯化 逆转录 裂解 | ||
1.一种单细胞测序筛选成纤维细胞标记分子的方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)提取肿瘤成纤维细胞;
2)分离单细胞并进行裂解:分离单细胞,加入裂解缓冲液中进行裂解,得到细胞裂解液;
3)对样品的mRNA进行逆转录得到cDNA:使用美国ThermoFisher公司的SuperScript试剂盒构建逆转录体系,对上述步骤2)获得的细胞裂解液进行逆转录,得到cDNA;
4)以cDNA为模板进行PCR扩增,构建测序文库,进行测序:使用美国Illumina公司的NexteraXT试剂盒,对上述步骤3)得到的逆转录产物进行扩增和纯化,构建高通量测序文库;完成后将文库送交测序;
5)对测序结果进行生物信息学分析,寻找肿瘤成纤维细胞特异性的标记分子。
2.根据权利要求1所述单细胞测序筛选肿瘤成纤维细胞标记分子的方法,其特征在于:所述步骤1)中,将从肿瘤组织中提取的成纤维细胞进行单细胞测序,从mRNA水平上寻找肿瘤成纤维细胞特异性的标记分子。
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