[发明专利]一种茄子CRISPR/Cas9基因敲除载体的构建方法和应用在审

专利信息
申请号: 201810637465.6 申请日: 2018-06-20
公开(公告)号: CN108728486A 公开(公告)日: 2018-11-02
发明(设计)人: 杨艳;庄勇;周晓慧;刘军 申请(专利权)人: 江苏省农业科学院
主分类号: C12N15/82 分类号: C12N15/82;C12N15/113;A01H4/00;A01H5/00;A01H6/82
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 张素卿
地址: 210014*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 茄子 构建 基因敲除载体 靶位点 表达盒 蛋白 生物技术领域 双元表达载体 基因组DNA 定点突变 突变株系 遗传转化 重组质粒 植株 高效率 农杆菌 基因 测序 介导 子叶 应用 验证 转入 转化
【权利要求书】:

1.一种茄子CRISPR/Cas9基因敲除植株的构建方法,包括:将含gRNA和Cas9蛋白的表达盒插入到pCAMBIA1301载体中产生敲除编辑载体和农杆菌介导的茄子遗传转化,其特征在于,gRNA靶位点设计在SmWRKY26基因5’端,序列为:P1:5’-ATTGCAGAGAGGACTGGTTC-3’;其反向互补序列P2:5’-GAACCAGTCCTCTCTGCAAT-3’;扩增靶位点对应的引物序列:

P3:5’-GATTGATTGCAGAGAGGACTGGTTC-3’;

P4:5’-AAACGAACCAGTCCTCTCTGCAATC-3’。

2.根据权利要求1所述的一种茄子CRISPR/Cas9基因敲除植株的构建方法,其特征在于,包括以下具体步骤:

(1)gRNA靶位点的选择

根据CRISPR/Cas9技术设计靶位点的原则,把gRNA靶位点设计在登录号为Sme2.5_01585.1_g00006.1的SmWRKY26的5’端第一个外显子上,序列为

P1:5’-ATTGCAGAGAGGACTGGTTC-3’,

P2:5’-GAACCAGTCCTCTCTGCAAT-3’;

(2)gRNA的设计和退火

以SmWRKY26基因组DNA SEQ ID NO:1为参照,设计扩增gRNA的引物序列,序列如下:根据psgR-cas9-At载体经BbsI酶切后产生的粘性末端序列以及G为转录起始位点的原则,设计扩增靶位点对应的引物序列:

P3:5’-GATTGATTGCAGAGAGGACTGGTTC-3’,

P4:5’-AAACGAACCAGTCCTCTCTGCAATC-3’;

将P3和P4分别稀释到10μM,并各取5μl等体积混合,进行退火反应得到gRNA产物;

反应条件:95℃,5min;95℃(-1℃/cycle),70cycles,1min;4℃保存;

(3)gRNA插入到psgR-cas9-At载体:

16℃过夜后,连接产物转化至大肠杆菌感受态,挑取单克隆,PCR并送样测序验证,得到中间载体即为包含gRNA和Cas9蛋白的表达盒,命名为pEA1;

(4)pEA1和pCAMBIA1301双酶切,37℃水浴3h后纯化酶切产物;pEA1和pCAMBIA1301的酶切产物分以5:1的摩尔比进行混合,加入1μl T4连接酶和1μl连接酶buffer,16℃过夜;连接产物转化至大肠杆菌感受态,挑取单克隆,PCR并送样测序验证,得到最终编辑载体命名为pEA2;酶切体系如下:

(5)遗传转化:将编辑载体pEA2电转化农杆菌EHA105感受态细胞,筛选阳性克隆;以茄子子叶为外植体进行遗传转化,经潮霉素抗性筛选,愈伤组织再生,获得遗传转化植株,并进行PCR和测序验证。

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