[发明专利]一种用于诊断脑梗塞的肠道菌群试剂盒及其应用在审
申请号: | 201810607301.9 | 申请日: | 2018-06-13 |
公开(公告)号: | CN108841972A | 公开(公告)日: | 2018-11-20 |
发明(设计)人: | 朱彧;岳伟;相蕾;阚鹏程;程乾胜;杨萍 | 申请(专利权)人: | 天津市环湖医院(天津市神经外科研究所天津市脑系科中心医院) |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6869;C12Q1/10;C12Q1/06;C12R1/185 |
代理公司: | 天津展誉专利代理有限公司 12221 | 代理人: | 陈欣 |
地址: | 300000*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 脑梗塞 肠道菌群 载体质粒 试剂盒 诊断 临床医疗领域 第二试剂 第一试剂 患者肠道 菌群结构 社会意义 水溶 引物 代谢 应用 转入 标本 基因 预防 探索 | ||
1.一种用于诊断脑梗塞的肠道菌群试剂盒,其特征在于,包括依次设置的如下试剂:
第一试剂为基因序列为5’-AGAGTTTGATCATGGCTC-3’和5’-CCGTCAATTCCTTTGAGTTT-3’的水溶引物;
第二试剂为pGEM-T easy载体质粒。
2.一种用于诊断脑梗塞的肠道菌群试剂盒应用,其特征在于:
a.将粪便标本的基因组DNA为模板,加入第一试剂为基因序列为5’-AGAGTTTGATCATGGCTC-3’和5’-CCGTCAATTCCTTTGAGTTT-3’的水溶引物中,以High-Fidelity PCR Master Mix with GC Buffer和高效高保真酶进行PCR扩增;
b.将PCR产物加入第二试剂载体质粒pGEM-T easy,使其连接,转染;
c.将连接,转染后产物,转入DH5α感受态细胞,并进行测序,测序结果使用GenBank的BLAST和RDP数据库进行比对,得到各微生物相对丰度,进行分析。
d.纲:gammaproteobacteria相对丰度高于23%;
科:enterobacteriaceae相对丰度高于22%;
目:enterobacteriales相对丰度高于22%;
属:escherichia_shigella:相对丰度高于20%可判断粪便样本与脑梗死患者有相关性。
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