[发明专利]一种鸡伴性浅芦花羽基因的鉴定引物及试剂盒、鉴定方法及应用

说明书

本发明涉及一种鸡伴性浅芦花羽基因的鉴定引物及试剂盒、鉴定方法及应用，属于动物遗传育种技术领域。本发明中鸡伴性浅芦花羽的分子标记为CDKN2A基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，第27bp处发生C到T的突变。依据该分子标记设计引物、试剂盒及检测方法，利用本发明提供的检测方法或试剂盒能够检测待测鸡是否携带浅芦花羽性状突变等位基因，从而确定待测鸡是否为浅芦花羽鸡。本发明通过改变引物3’端的碱基来引入限制性内切酶Asu I识别位点，降低了检测成本，提高了检测效率。在实际生产和育种中，可以利用该方法准确剔除或纯合浅芦花羽性状。

技术领域

本发明涉及一种鸡伴性浅芦花羽基因的鉴定引物及试剂盒、鉴定方法及应用，属于动物遗传育种技术领域。

背景技术

鸡的羽色十分丰富，羽色是鸡的重要品种特征之一。羽色能直接反映鸡的生长和健康状态，其发育状态是决定优质肉鸡经济价值的重要因素。在优质鸡市场上，鸡只的羽毛颜色、色泽、形态等外观性状是影响优质鸡价格的重要因素，因此，羽色是优质鸡育种工作中一项重要选择指标。在畜牧生产上，性别与畜禽的生产性能相关性很大。在奶牛场，出生下来的公牛犊绝大多数直接被淘汰，母牛犊被留下来用于牛奶生产；在蛋鸡场，母雏鸡比公雏鸡的经济价值大的多；在肉鸡场，公鸡的生长速度比母鸡的要好，因此畜禽的性别鉴定对于畜牧生产具有非常重要的意义。但家禽的生殖器官多位于体内，出壳时多数通过翻肛鉴别公母，这种方法技术要求高，费时费工且还对雏鸡造成大的应激。所以蛋鸡、肉鸡生产中，多数采用羽色，羽速的伴性遗传来鉴别公母。

鸡的浅芦花羽也叫哥伦比亚羽，是一种颈部和尾部的羽毛末端为黑色，其余全为白羽的羽色，其为性连锁浅芦花羽，其外观相对好看，易受消费青睐，浅芦花羽市场占有率高。浅芦花羽为一种羽色性状，伴性浅芦花羽是伴性遗传的羽色性状。豫粉1号H系具有典型的浅芦花羽特征，该性状是位于Z染色体上且伴性遗传。因此，在国审新品种豫粉1号蛋鸡配套系商品代鸡生产过程中，利用H系浅芦花羽性状实现商品代雏鸡可根据羽毛颜色进行鉴别雌雄。这种鉴别方式快捷，省时省工，准确率也高。

细胞周期依赖性激酶抑制基因(cyclin-dependent kinase inhibitor,CDKN2A)是一种重要的抑癌基因，属于细胞周期依赖性激酶抑制因子基因家族。Doreen等(2017)研究发现CDKN2A基因调控区和编码区的碱基突变导致了鸡横斑芦花不同表型形成。横斑芦花羽的表型是由B1等位基因控制，中国农业大学邓雪梅教授已根据B1等位基因开发出与横斑芦花羽相关的分子标记，申请了发明专利《一种鸡伴性横斑羽基因的鉴定方法》并获得授权。但是，目前还没有较为方便的、价格便宜的浅芦花羽基因的鉴定方法。

发明内容

本发明的目的是提供一种鸡伴性浅芦花羽基因的鉴定引物，上游引物第23位的模板序列C改变为G，形成限制性内切酶的识别序列GGTCC，成为人工酶切位点，以方便鸡伴性浅芦花羽基因的检测。

本发明还提供了包含上述引物的试剂盒。

本发明还提供了使用上述引物或试剂盒鉴定鸡伴性浅芦花羽基因的方法。

本发明还提供了上述引物、试剂盒或鉴定方法在鸡浅芦花羽性状育种中的应用。

为了实现上述目的，本发明所采用的技术方案是：

一种鸡伴性浅芦花羽基因的鉴定引物，其核苷酸序列如下所示：

上游引物5‘-TGACCTCTCGGATAAGGTGCACGTC-3’；

下游引物5‘-CTCCTTCTCAGAACCCGGC-3’。