[发明专利]一种转录组数据的表达定量方法及系统

权利要求书

1.一种转录组数据的表达定量方法，其特征在于，所述方法，包括：

将转录组样品进行测序，获得数据，以及将所述数据比对上参考基因组，获得比对结果；

处理所述比对结果，得到单碱基的测序深度；

根据所述单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度；

根据所述外显子平均测序深度进行聚类，将表达稳定且平均测序深度最小的基因确定内参基因；

根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度，将转录组数据进行归一化定量；

所述将转录组样品进行测序，获得数据，以及将所述数据与参考基因组比对，获得比对结果，包括：

将转录组样品通过Illumina平台进行测序，获得数据，以及将所述数据通过BWA与参考基因组比对，获得比对结果；

所述统计单碱基的测序深度，包括：

通过SAMtools软件处理所述比对结果，得到单碱基的测序深度；

所述根据所述单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子的平均测序深度，包括：

累加外显子单碱基深度，再除以所述外显子长度；

所述根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度，将转录组数据进行归一化定量，包括：

将外显子平均测序深度除以参考基因的外显子平均测序深度，得到转录组数据的表达量。

2.一种转录组数据的表达定量系统，其特征在于，所述系统，包括：测序单元、比对单元、处理单元、计算单元、确定单元和定量单元；其中，

所述测序单元，用于将转录组样品进行测序，获得数据；

所述比对单元，用于将所述数据比对上参考基因组，获得比对结果；

所述处理单元，处理所述比对结果，得到单碱基的测序深度；

所述计算单元，用于根据所述单碱基的测序深度和外显子长度计算外显子平均测序深度；

所述确定单元，用于根据所述外显子平均测序深度进行聚类，将表达稳定且平均测序深度最小的基因确定内参基因；

所述定量单元，用于根据外显子平均测序深度和内参基因的外显子平均测序深度，将转录组数据进行归一化定量；

所述测序单元，具体用于将转录组样品通过Illumina平台进行测序，获得数据；

所述比对单元，具体用于：将所述数据通过BWA与参考基因组比对，获得比对结果；

所述处理单元，具体用于：

通过SAMtools软件处理所述比对结果，得到单碱基的测序深度；

所述计算单元，具体用于：

累加外显子单碱基深度，再除以所述外显子长度；

所述定量单元，具体用于：

将外显子平均测序深度除以参考基因的外显子平均测序深度，得到转录组数据的表达量。