[发明专利]一种杂交鹅掌楸亲缘关系的鉴定方法有效
| 申请号: | 201810543423.6 | 申请日: | 2018-05-29 |
| 公开(公告)号: | CN108660196B | 公开(公告)日: | 2019-09-10 |
| 发明(设计)人: | 陈金慧;龙晓飞;施季森;成铁龙;肖保荣;刘思芹;翁禹豪;胡凌峰;刘阳 | 申请(专利权)人: | 南京林业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/6895 |
| 代理公司: | 南京申云知识产权代理事务所(普通合伙) 32274 | 代理人: | 邱兴天 |
| 地址: | 210037 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 母本 杂交鹅掌楸 特异性扩增 引物 亲缘关系 种源 专用试剂盒 特异扩增 幼苗阶段 叶片DNA | ||
1.一种杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取后代树种的叶片DNA;
2)进行PCR检测;
3)用引物18.2能特异性扩增出400bp的产物的母本为中国鹅掌楸,能特异性扩增出382bp的产物母本为北美鹅掌楸;
4)再用引物700对已鉴别为母本为中国鹅掌楸的进行PCR扩增,能特异性扩增出700bp产物的母本为中国鹅掌楸西部种源,能特异扩增出242bp产物的母本则为中国鹅掌楸东部种源;对已鉴别为母本为北美鹅掌楸的用引物700进行PCR扩增,均特异获得700bp的产物。
2.根据权利要求1所述的杂交鹅掌楸亲缘关系的鉴定方法,其特征在于,步骤1)中,叶片为刚展开的嫩叶,液氮处理后放置-80℃备用。
3.根据权利要求1所述的杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定方法,其特征在于,步骤2)中,DNA提取采用CTAB法进行。
4.根据权利要求1所述的杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定方法,其特征在于,步骤3)中,PCR扩增的10μL体系为:75ng基因组DNA,1.0μL 10×PCR Buffer,1.2μL 2.5mM·L-1MgCl,0.2μL10mM·L-1dNTP,0.5μL 10μM·L-1引物18.2左端引物,0.5μL 10μM·L-1引物18.2右端引物和0.5个单位Taq酶,ddH2O补足10μL,其中,引物18.2左端引物序列为:AATTCTCTCAATTTCACTTTGCCT;引物18.2右端引物序列为:TGGTCGATGCATTCTGTTTCT。
5.根据权利要求1所述的杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定方法,其特征在于,步骤3)中,采用Touch-downPCR扩增程序:95℃预变性4min,94℃变性15s,60℃(△=-1℃)复性30s,72℃延伸30s,6个循环;94℃变性15s,55℃复性30s,72℃延伸30s,24个循环,72℃延伸10min,4℃保存。
6.根据权利要求1所述的杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定方法,其特征在于,步骤4)中,10μLPCR扩增的体系为:75ng基因组DNA,1.0μL 10×PCR Buffer,1.2μL 2.5mM·L-1MgCl,0.2μL10mM·L-1dNTP,0.5μL 10μM·L-1引物700左端引物,0.5μL 10μM·L-1引物700右端引物和0.5个单位Taq酶,ddH2O补足10μL,其中,引物700左端序列为:TATGGTATATTCTATTCGGTT;引物700右端序列为:TCATTCCAATTCTACCGAT。
7.根据权利要求1所述的杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定方法,其特征在于,步骤4)中,采用Touch-downPCR扩增程序为:95℃预变性4min,94℃变性15s,58℃(△=-1℃)复性30s,72℃延伸45s,6个循环;94℃变性15s,55℃复性30s,72℃延伸45s,24个循环,72℃延伸10min,4℃保存。
8.权利要求1所述的杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定方法的专用试剂盒,其特征在于,至少包括用量为1次以上的引物试剂,所述的引物试剂的引物序列为:引物18.2左端引物序列为:AATTCTCTCAATTTCACTTTGCCT;引物18.2右端引物序列为:TGGTCGATGCATTCTGTTTCT;引物700左端序列为:TATGGTATATTCTATTCGGTT;引物700右端序列为:TCATTCCAATTCTACCGAT。
9.根据权利要求8所述的专用试剂盒,其特征在于,还包括DNA标样试剂、DNA提取试剂、电泳试剂中的一种以上;所述的DNA标样至少包含242bp、382bp、400bp以及700bp四个条带。
10.权利要求8或9所述的专用试剂盒在杂交鹅掌楸亲缘关系鉴定中的应用。
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