[发明专利]ddx27基因缺失斑马鱼突变体的制备方法有效
申请号: | 201810525964.6 | 申请日: | 2018-05-28 |
公开(公告)号: | CN108753834B | 公开(公告)日: | 2021-11-23 |
发明(设计)人: | 张庆华;时灿;岳倩文;祖尧;李伟明 | 申请(专利权)人: | 上海海洋大学 |
主分类号: | C12N15/90 | 分类号: | C12N15/90;C12N15/113;A01K67/027 |
代理公司: | 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 | 代理人: | 曹莉 |
地址: | 201306 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ddx27 基因 缺失 斑马 突变体 制备 方法 | ||
1.一种斑马鱼ddx27基因缺失突变体的制备方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
S1、确定ddx27基因敲除的靶点在斑马鱼ddx27基因第6个外显子上设计gRNA序列;所述靶点序列为如SEQ ID NO.1所示的序列;所述gRNA的序列为如SEQ ID NO.6所示的序列;
S2、设计合成gRNA的上游引物T7-ddx27-sfd、下游引物tracrrev;
S3、以pUC19-gRNAscaffold质粒为模板,使用引物T7-ddx27-sfd、tracrrev进行PCR扩增;所述引物T7-ddx27-sfd的序列为如SEQ ID NO.2所示的序列;所述引物tracr rev的序列为如SEQ ID NO.3所示的序列;
S4、对步骤S3的PCR产物进行体外转录,转化获得gRNA;
S5、将gRNA与Cas9蛋白导入斑马鱼中;
S6、培养获得稳定遗传的斑马鱼ddx27基因突变体;具体包括如下步骤:
A1、分别取导入gRNA与Cas9蛋白的斑马鱼以及野生型未注射的斑马鱼胚胎进行ddx27基因敲除效率的检测,确定ddx27基因敲除阳性的F0养至成鱼;
A2、将ddx27基因敲除阳性F0成鱼与野生型斑马鱼外交,进行可遗传性及有效突变检测,筛选可遗传的有效突变F1进行喂养至成鱼;经基因型鉴定获得ddx27F1突变体斑马鱼;
A3、将相同突变的ddx27F1突变体斑马鱼内交,获得ddx27F2突变体斑马鱼;
A4、鉴定为F2代中ddx27基因敲除的纯合子即所述稳定遗传的斑马鱼ddx27基因突变体;
获得的ddx27-/-突变体斑马鱼具有发育迟缓、畸形的明显表型;所述发育迟缓、畸形包括小头、小眼、心包水肿。
2.根据权利要求1所述的斑马鱼ddx27基因突变体的制备方法,其特征在于,步骤S5中,将gRNA与Cas9蛋白导入斑马鱼具体为:将gRNA与Cas9蛋白混合,显微注射到斑马鱼一细胞期胚胎中;其中,gRNA终浓度为80-100ng/μL,Cas9蛋白终浓度为800ng/μL;总体积V=1μL。
3.根据权利要求1所述的斑马鱼ddx27基因突变体的制备方法,其特征在于,步骤A1中,ddx27基因敲除检测采用的引物序列包括如SEQ ID NO.4所示的序列的上游引物ddx27-F和如SEQ ID NO.5所示的序列的下游引物ddx27-R。
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