[发明专利]一种胎儿染色体非整倍体检测中DNA的检测及质控方法在审
申请号: | 201810484123.5 | 申请日: | 2018-05-19 |
公开(公告)号: | CN108642161A | 公开(公告)日: | 2018-10-12 |
发明(设计)人: | 杨瑶;余艳 | 申请(专利权)人: | 长沙金域医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/6804;C40B50/06 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 410000 湖南省长沙市高新开发区麓天路*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 质控 检测 胎儿染色体 非整倍体 综合征 辅助诊断 结果分析 浓度测定 文库构建 样本采集 保存 测序 上机 文库 申请 便利 灵活 清晰 环节 | ||
1.一种胎儿染色体非整倍体检测中DNA的检测及质控方法,其特征在于,包括:
步骤A:样本采集、保存及质控;
步骤B:DNA提取;
步骤C:文库构建;
步骤D:文库浓度测定及保存;
步骤E:上机测序;
步骤F:结果分析;
其中,所述步骤A包括:
样本采集:采血管一采集5.0mL孕妇外周血,采集完毕后,轻柔颠倒采血管并及时将采血管放置冰箱中;采血管二采集10.0mL孕妇外周血,采集完毕后,轻柔颠倒采血管并常温保存;预冷低速离心机至温度稳定后,放入采血管二,离心分钟,吸取上清血浆,转移至置于冰盒上的2.0mLEP管中,标记相应的样品编号;预冷高速离心机至温度稳定后,放入上步所得2.0mLEP管并离心,枪头对着非白细胞沉淀处,在冰盒上吸取上清血浆,分装至置于冰盒上的1.5mLEP管中,每管转入400uL血浆,标记样品编号和血浆管数,立即放入冰箱中保存;对该保存的样品进行质控和处理。
2.根据权利要求1所述的胎儿染色体非整倍体检测中DNA的检测及质控方法,其特征在于,所述步骤C包括:
步骤a:对样本DNA进行物理打断,得到片段化DNA溶液;
步骤b:对所述片段化DNA进行末端修复及磁珠纯化,得到纯化好的平末端DNA;
步骤c:对所述平末端DNA进行接头连接,得到连接接头的DNA;
步骤d:对所述连接接头的DNA进行PCR扩增,得到文库;
其中,所述步骤c具体包括:
在离心管中依次加入平末端DNA、无核酸酶水、连接缓冲液、dNTP、DNA连接酶、P1接头和标签序列X并混匀,反应后加入磁珠吹打混匀,静置5分钟;
将离心管放置在磁力架上,待磁珠吸附完全溶液变澄清之后吸去上清;加入75%乙醇,转动离心管,溶液澄清后吸去上清;
取下离心管,离心数秒后将离心管置于磁力架上,待磁珠吸附完全之后吸去残留溶液,敞开管盖,室温晾干;
加入TE溶液,吹打混匀后静置;瞬时离心后将离心管置于磁力架上静置至溶液澄清,将管内液体转移至PCR管,得到连接接头的DNA。
3.根据权利要求2所述的胎儿染色体非整倍体检测中DNA的检测及质控方法,其特征在于,所述步骤D包括:
步骤D1:稀释待测样品,准备标准品,并将两者都低温保存;
步骤D2:取离心管,在管盖上做好标记,按照下表中的反应体系配制反应混合液,配制时按照每个样品做2次重复反应所需的量配制体系,反应混合液包括定量扩增试剂、无核酸酸酶水、P1引物和P2引物,配制完成后,将反应混合液振荡,瞬时离心至管底;
步骤D3:将所述步骤D2中配好的反应混和液加到反应板的各反应管孔中,向标准品反应孔中分别加入2L的标准品,每个反应板同时设置无模板对照反应孔,孔中加入2uL无核酸酶水;
步骤D4:使用封膜工具和光学粘性膜密封所述反应板,使用离心机离心反应板,将反应板装载到荧光定量PCR扩增仪并进行设置后开始运行qPCR反应,得到文库浓度测定结果。
4.根据权利要求3所述的胎儿染色体非整倍体检测中DNA的检测及质控方法,其特征在于,所述步骤D4中设置程序具体包括:
步骤1:在Plate Setup界面,选好标准品孔和样本孔,重复系数均为2;
步骤2:在荧光定量PCR扩增仪上设置程序:先95℃1分钟;后95℃15秒,65℃15秒,72℃30秒循环30次;再后95℃15秒,65℃1分钟,95℃15秒;
步骤3:在Melting Curve Stage阶段中设置“65℃1分钟,95℃15秒”,65℃到95℃的升温过程中设置收集熔解曲线,如有收集熔解曲线方式选项,则选择Step and hold方式;
步骤4:设置反应体系为20uL,单击RUN开始进行qPCR反应。
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