[发明专利]一种巢式PCR检测试剂盒及其在黄栌枯萎病菌检测中的应用在审

专利信息
申请号: 201810463409.5 申请日: 2018-05-15
公开(公告)号: CN108315392A 公开(公告)日: 2018-07-24
发明(设计)人: 周江鸿;夏菲;车少臣 申请(专利权)人: 北京市园林科学研究院
主分类号: C12Q1/6848 分类号: C12Q1/6848;C12Q1/6895;C12Q1/04
代理公司: 北京格允知识产权代理有限公司 11609 代理人: 谭辉;周娇娇
地址: 100102*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 引物 枯萎病菌 试剂盒 检测 检测试剂 巢式PCR 准确度 高灵敏度 扩增 应用
【说明书】:

发明提供了一种巢式PCR检测试剂盒,所述试剂盒包括:用于第一轮PCR扩增的引物P1和引物P2;和用于第二轮PCR扩增的引物PN1和引物PN2;所述引物P1、P2、PN1和PN2在PCR扩增反应中分别具有与SEQ ID NO.1至4相同或相似的扩增功能。本发明还提供所述试剂盒在检测黄栌枯萎病菌(Verticillium dahliae)中的应用。本发明还提供了一种利用所述试剂盒来检测黄栌枯萎病菌的方法。本发明可以高灵敏度、高准确度快速地检测黄栌枯萎病菌。

技术领域

本发明属于园林植物病害检测、鉴定及防治技术领域,具体涉及一种用于检测黄栌枯萎病菌的检测试剂盒及其使用方法。

背景技术

黄栌(Cotinus coggygria),又名黄道栌或红叶,漆树科黄栌属植物;落叶灌木或小乔木,株高3米至5米,秋季经霜后叶色艳红,是极具观赏价值和经济价值的树种,作为北京香山公园的主要红叶树种,吸引着大量的中外游客,在红叶文化的传承中具有不可替代的作用。

但是,自上世纪80年代以来,因感染大丽轮枝菌(Verticillium dahliae),北京、山东等地黄栌出现了大面积枯死现象,其中北京香山公园黄栌林因枯萎病出现了大面积枯死现象,每年枯死的黄栌一度达到数千株,园内黄栌枯萎病发病率高达46.2%,严重影响了香山的红叶景观。目前黄栌枯萎病已成为为害黄栌的一种毁灭性病害,是北京城市园林生态系统建设中函待解决的难题之一。

多年来北京林业大学及香山公园对黄栌枯萎病的致病菌、发病因子、药剂防治方法等进行了深入研究,但仍未有效控制黄栌枯萎病的发生(宋立洲,杜万光,李维维.2011.香山公园黄栌枯萎病防治技术研究.北京园林,27(2):51-56;葛雨萱,周肖红,刘洋,等.2014.黄栌属种质资源、栽培繁殖、化学成分、叶色调控研究进展.园艺学报,41(9):1833-1845;雷增普.1993.北京地区黄栌黄萎病病原菌的研究.北京林业大学学报,15(3):88-93),主要原因之一是大丽轮枝菌的已知寄主植物超过200种,许多园林植物及林下杂草都是其无症状带菌体,这些植物虽然体内含有大丽轮枝菌,但本身并不表现任何症状,成为黄栌枯萎病传播的重要介体(Inderbitzin,P.,and Subbarao,K.V.2014.Verticilliumsystematics and evolution:How confusion impedes Verticillium wilt managementand how to resolve it.Phytopathology,104:564-574;王正芬.棉花黄萎病菌(Verticillium dahliae Kleb.)的寄主种类鉴定.西北农业大学学报,1987,15(1):35-48)。传统的病原物分离、鉴定技术费时费力,难以对大量苗木进行快速检测。因此,探求有效、快速的黄栌枯萎病菌(Verticillium dahliae)的检测技术对黄栌枯萎病的防治具有重要的生产实践意义。

PCR技术的发展推动了植物病害诊断和病原菌鉴定工作,朱有勇等(1999)根据棉花黄萎病菌(Verticillium dahlia)核糖体基因ITS区段的碱基编码序列,设计了一对26bp的PCR特异性扩增引物用于棉花黄萎病菌的分子鉴定和分子监测,但不能区分不同致病类型。Encarnacion等(2000)选用17株棉花黄萎病菌和5株油橄榄黄萎病菌(Verticilliumdahlia)落叶型菌株,以及18株棉花黄萎病菌和7株油橄榄黄萎病菌非落叶型菌株,利用RAPD-PCR方法分别筛选到落叶型黄萎病菌和非落叶型黄萎病菌的特征性条带,对该特异性条带进行测序,并进行Blast比对,无相似性片段报道。但是,在生产实际中,由于土壤理化性质和生态系统的复杂性,土壤中的棉花黄萎病菌所占比例很低,通过常规PCR方法很难检测到其存在。另外,由于植物基因组序列的不同和病原菌的快速变异,现有检测技术不适合进行大丽轮枝菌的快速检测。

因此,针对以上不足以及黄栌枯萎病治理的紧急需要,迫切需要一种能够快速、灵敏、准确地检测黄栌枯萎病菌的方法。

发明内容

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