[发明专利]西瓜粘籽基因SNP分子标记及其筛选方法和应用有效

专利信息
申请号: 201810391810.2 申请日: 2018-04-27
公开(公告)号: CN108315328B 公开(公告)日: 2021-04-02
发明(设计)人: 李娜;马双武;尚建立;王吉明;周丹;李楠楠 申请(专利权)人: 中国农业科学院郑州果树研究所
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/6895;C12Q1/6858
代理公司: 河南科技通律师事务所 41123 代理人: 张晓辉;樊羿
地址: 450009 河南*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 西瓜 基因 snp 分子 标记 及其 筛选 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种西瓜粘籽基因SNP位点的dCAPs分子标记的扩增引物在鉴定和辅助筛选粘籽种质类型西瓜中的应用,其特征在于,扩增所述分子标记的上游引物核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示;扩增所述分子标记的下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

2.一种西瓜粘籽基因型的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

a. DNA提取:利用CTAB法提取西瓜叶片总DNA;

b. PCR扩增:

反应体系为:100 ng/μL的西瓜叶片总DNA 1μl、权利要求1中 所述上游引物1 μl、权利要求1中 所述下游引物1 μl、2×Power Taq PCR MasterMix 12.5 μl、ddH2O 9.5 μl;

反应程序为:94℃ 5 min,35个循环的94℃ 20 s、55℃ 1 min、72℃ 30 s、72℃ 5min;

c. 酶切反应体系和程序:

反应体系为:PCR产物5 μl, Tag I限制性内切酶0.5μl,10×buffer 1.5 μl,ddH2O 8 μl;

反应程序为:65℃恒温处理10小时;

d.电泳图谱分析:对所述酶切产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳、显影、染色和带型判读,找到目标条带,根据扩增产物的条带大小及位置关系确定所属基因型,165bp的条带代表粘籽西瓜基因型,184bp的条带代表非粘籽西瓜基因型。

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