[发明专利]一种用于石榴干腐病菌LAMP快速检测的引物组合物及其应用有效
申请号: | 201810390017.0 | 申请日: | 2018-04-27 |
公开(公告)号: | CN108315391B | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 杨雪;陈雨;谷春艳;臧昊昱 | 申请(专利权)人: | 安徽省农业科学院植物保护与农产品质量安全研究所 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 高宁馨 |
地址: | 230031 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 石榴 病菌 lamp 快速 检测 引物 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于石榴干腐病菌LAMP快速检测的引物组合物,其特征在于,由F3、B3、FIP和BIP四条引物组成,所述引物F3、B3、FIP和BIP的核苷酸序列分别如下所示:
F3:5’-GGTCACCGTGACTTCATCAA-3’;
B3:5’-CCTTCCACTCAGCAGTGTC-3’;
FIP:5’-CACCAGTACCGGAGGCAATGATCATGATCACTGGTACCTCGC-3’;
BIP:5’-GCTGGTATCTCCAAGGATGGCCACGATGAGCTGCTTGACAC-3’。
2.权利要求1所述的LAMP引物组合物在制备石榴干腐病菌检测试剂中的应用。
3.权利要求1所述的LAMP引物组合物在检测和/或鉴定石榴干腐病菌中的应用。
4.一种用于检测石榴干腐病菌的试剂,其特征在于包含权利要求1所述的引物组合物。
5.一种石榴干腐病菌LAMP快速检测方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)提取待检样品DNA,采用CTAB法提取待检样品的DNA;
(2)以提取的DNA为模板,利用权利要求1所述的LAMP引物组合物进行LAMP扩增;
(3)LAMP扩增反应结束按照以下任意一种方式观察结果:
1)向扩增产物中加入显色剂,轻晃混匀,即可观察颜色变化,扩增产物显示为黄绿色,表明待测样品中含有石榴干腐病菌;扩增产物显示为橙红色,表明待测样品中不含有石榴干腐病菌;
2)取扩增产物在2%琼脂糖凝胶电泳中电泳,观察扩增结果,如果LAMP扩增产物的电泳图谱为梯状条带,表明含有石榴干腐病菌;如果扩增产物的电泳图谱无扩增条带,表明不含有石榴干腐病菌:
所述的显色剂为SYBR Green I。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于步骤(2)所述LAMP扩增的反应体系为20μL,由下列浓度体积的组分组成:
用无菌双蒸水补充扩增体系体积到20μL。
7.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于步骤(2)所述LAMP扩增的反应条件为:65℃保温60min。
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