[发明专利]一种利用TCF21基因mRNA表达量鉴定低脂肉鸡的方法有效

专利信息
申请号: 201810311759.X 申请日: 2018-04-09
公开(公告)号: CN108531612B 公开(公告)日: 2021-06-01
发明(设计)人: 李辉;张心扬;张慧;程博涵 申请(专利权)人: 东北农业大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 代理人: 邓宇
地址: 150030 黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 一种 利用 tcf21 基因 mrna 表达 鉴定 肉鸡 方法
【权利要求书】:

1.一种利用TCF21基因mRNA表达量鉴定低脂肉鸡的方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)引物设计与合成:设计并合成用于扩增TCF21基因CDS区的引物对及用于扩增TBP基因CDS区的引物对,其中,所述用于扩增TCF21基因CDS区的引物对是以鸡TCF21基因mRNA序列为模板设计的,上游引物为TCF21-F,其序列如SEQ ID No:1所示,下游引物为TCF21-R,其序列如SEQ ID No:2所示,所述用于扩增TBP 基因CDS区的引物对是以鸡TBP基因mRNA序列为模板设计的,上游引物为TBP-F,其序列如SEQ ID No:3所示,下游引物为TBP-R,其序列如SEQ ID No:4所示;

(2)提取待测肉鸡腹部脂肪组织总RNA并进行反转录获得cDNA;

(3)实时荧光定量PCR:分别利用步骤(1)所述的引物对,以待测肉鸡腹部脂肪组织cDNA为模板进行荧光定量PCR;

(4)鉴定是否为低脂肉鸡:对步骤(3)所述实时荧光定量PCR的Ct值进行统计分析,当待测肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因mRNA的相对表达量小于0.125时,鉴定待测肉鸡为低脂肉鸡,所述相对表达量是以TBP基因为内参计算获得的,具体采用2−ΔCt方法计算,其中ΔCt =CtTCF21-CtTBP,CtTCF21为TCF21基因荧光定量PCR反应中荧光信号到达设定的阈值时经历的循环数,CtTBP为TBP基因荧光定量PCR反应中荧光信号到达设定的阈值时经历的循环数。

2.根据权利要求1所述的一种利用TCF21基因mRNA表达量鉴定低脂肉鸡的方法,其特征在于,步骤(2)所述总RNA提取方法为Trizol法。

3.根据权利要求1所述的一种利用TCF21基因mRNA表达量鉴定低脂肉鸡的方法,其特征在于,步骤(2)所述反转录条件为:(1)总RNA 1μg,2.5μM oligo dT引物0.5μl,再加入RNase-free水补至5μl,反应条件为:70℃ 5min,冰浴5min;(2)然后向上述体系中加入如下试剂:

5×PCR reaction buffer 4μl

10mmol/L dNTP Mixture 1μl

25mmol/L MgCl2 2.4μl

40U/μl RNase Inhibitor 0.5μl

Reverse Transcriptase 1μl

RNase-free ddH2O 6.1μl

加水补至 20μl

反应条件:25℃ 5min,42℃ 60min,70℃ 15min,4℃ 保温,获得cDNA。

4.根据权利要求1所述的一种利用TCF21基因mRNA表达量鉴定低脂肉鸡的方法,其特征在于,步骤(3)所述荧光定量PCR反应体系为:

FastStart Universal SYBR Green Master 5μl

10μmol/L上游引物 0.2μl

10μmol/L下游引物 0.2μl

cDNA 1μl

灭菌水 3.6μl

反应条件为:95℃预变性10min,95℃ 15s,60℃ 1min,共40个循环,每个样品设置3个重复。

5.根据权利要求1所述的一种利用TCF21基因mRNA表达量鉴定低脂肉鸡的方法,其特征在于,步骤(4)所述统计分析利用JMP软件进行。

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