[发明专利]基于云计算的生物信息分析系统

说明书

本发明公开基于云计算的生物信息分析平台。其包括计算机、与所述计算机通信连接的云服务器，以及通过网页服务器与所述云服务器进行数据交互的云计算平台，所述云计算平台包括：用户界面模块，用于用户登录及可视化操作；上传及管理模块，用于数据及数据库的上传及管理；项目管理模块，用于生物信息分析项目的创建、查看、编辑、进程管理及输出；所述生物信息分析平台包括多个子平台，各子平台相互独立。利用本发明提高的生物信息分析平台，研究人员只需输入原始测序数据，所述平台进行流程自动化分析，最后直接生成相应的结果文件及结果报告，提高了分析效率。

技术领域

本发明涉及生物信息分析技术领域，尤其涉及基于云计算的生物信息分析系统。

背景技术

云计算是一种新兴的商业计算模型。它将计算任务分布在大量称为云服务器的计算机构成的资源池上，使各种应用系统能够根据需要获取计算能力、存储空间和各种软件服务。云服务器将所有的计算资源集中起来，并由软件实现自动管理，无需人为参与。这使得应用提供者无需为繁琐的细节而烦恼，能够更加专注于自己的业务，有利于创新和降低成本。而且利用计算机解决问题时，用户启动计算机输入编制好的计算机程序，计算机可以自动执行，不需要用户直接干预运算、处理和控制过程，数据处理的自动化程度高。

随着测序技术的快速发展，基因研究机构、医学科研机构和公司产生了海量的生物学测序数据。但是众所周知，实验测序得到的原始数据并不能直接提供有价值的科学研究信息或疾病治疗药物的关联信息，需要利用生物信息学分析技术对这些数据进行计算挖掘，从而给出清晰且易于导出结论的结果信息。生物信息学是在生命科学的研究中以计算机为主要研究工具对生物学数据进行存储和计算分析，面对高通量测序所产生的海量数据，越来越多的研究人员或公司基于高性能计算机集群通过安装各种生物信息分析软件来进行计算分析。生物信息分析涉及多种测序数据，现在技术中，细菌测序数据、真菌测序数据、有参全长转录组测序数据和无参全长转录组测序数据的分析一般分别在单独的生物信息分析系统上进行，分析所有的这些数据需要在计算机上搭建不同的分析系统，每个分析系统又涉及多个分析软件和程序，因为分析软件和程序是内置于各分析系统内的，从而造成分析软件和程序在各分析系统内存在重复安装、资源浪费的问题，并且利用计算机进行数据处理时，不适宜的资源浪费会占用计算机内存空间，降低其运行速度，导致分析过程缓慢，分析效率低下，而且，用户在进行生物信息分析时需要不同的测序数据使用不同的系统，用户使用感较差。

生物信息分析过程是很多分析软件和程序相互关联，通过不同的步骤方法处理数据后得到最终的分析结果，由于这些分析软件层出不断、更新迭代，每个分析程序参数、文件格式、运行方式各异，研究人员不断的要去研究新的软件方法并在计算机或集群上安装部署，而且这些分析软件完成分析后得到的数据，还需研究人员进行进一步人工整理，无法自动获取最终的分析结果并生成图表或文字表示的报告。所以设计构建一种自动化程度高的生物信息分析系统十分必要。

发明内容

为克服上述现有技术的不足，本发明提供基于云计算的生物信息分析系统。其目的是解决目前生物信息分析系统搭建繁琐，资源浪费严重，分析数据量大且分析软件多，各软件之间衔接配置复杂以及人工整理分析数据而导致分析效率低下、自动化程度低的技术问题。

本发明是通过以下技术方案予以实现的：

基于云计算的生物信息分析系统，包括计算机、与所述计算机通信连接的云服务器，以及通过网页服务器与所述云服务器进行数据交互的云计算系统，其中，所述云计算系统包括：用户界面模块，用于用户登录及可视化操作；上传及管理模块，用于数据及数据库的上传及管理；项目管理模块，用于生物信息分析项目的创建、查看、编辑、进程管理及输出，所述创建包括分析创建和管道创建，创建分析的同时还创建报告模板，创建的管道用于各分析软件之间的数据连接，所述进程管理包括数据导入、管道添加与删除、定义规则文件与输入文件、项目运行及监控，所述输出包括结果查看和报告导出；

所述生物信息分析系统集成有多个生物信息分析子系统，各子系统之间相互独立。