[发明专利]科氏梭菌特异性探针及其用途在审

专利信息
申请号: 201810288852.3 申请日: 2018-04-03
公开(公告)号: CN108517366A 公开(公告)日: 2018-09-11
发明(设计)人: 周荣清;胡林涛;黄钧;李慧 申请(专利权)人: 四川大学
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6841;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/145
代理公司: 成都虹桥专利事务所(普通合伙) 51124 代理人: 梁鑫
地址: 610065 四川*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 科氏梭菌 特异性探针 窖泥 梭菌 检测 互补核酸探针 荧光原位杂交 分子生物学 浓香型白酒 序列设计 窖池 窖龄 探针 酿酒 变迁 剖析 应用 分析
【权利要求书】:

1.科氏梭菌特异性探针,其特征在于,核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。

2.根据权利要求1所述的科氏梭菌特异性探针,其特征在于:在探针的5’端还连接有花青染料荧光素CY3。

3.权利要求1或2所述的科氏梭菌特异性探针的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:下载NCBI数据库中梭菌科所有微生物的16S rRNA中的全长序列,并进行16S rRNA比对,找出种内保守,种间特异的一段寡核苷酸序列SEQ ID NO:2,根据SEQ ID NO:2进行设计合成。

4.权利要求1或2所述的科氏梭菌特异性探针在检测科氏梭菌含量中的用途。

5.根据权利要求4所述的用途,其特征在于:所述科氏梭菌为酿酒窖泥中的科氏梭菌。

6.采用权利要求1或2所述的科氏梭菌特异性探针检测酿酒窖泥中科氏梭菌的方法,包括以下步骤:

a、样品处理

将待测样品用焦磷酸钠溶液稀释后,涂于载玻片上,35~40℃保温1.5~2h,脱水、风干,再取溶菌酶溶液涂于载玻片上,孵育0.5~2h;

b、探针杂交

将步骤a得到的载玻片脱水、风干,将科氏梭菌特异性探针溶液滴加至载玻片上,40~45℃避光杂交1.5~2.5h,在提前预热至45~50℃的清洗缓冲溶液中洗涤0.5~1h,干燥,采用抗荧光淬灭剂封片,-20℃避光存放;

c、荧光显微镜观察

采用绿光作为激发光,荧光显微镜下观察,计算得到科氏梭菌的含量。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:步骤a中所述待测样品稀释前,先采用多聚甲醛溶液对所收集菌体细胞进行固定,离心,弃上清后,加入pH 7.0~8.0的PBS缓冲液定容。

8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:步骤a中所述稀释后的菌体浓度为106~107个细胞/mL。

9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:步骤b中所述的科氏梭菌特异性探针溶液是指20~30ng/μL的探针与杂交缓冲溶液按体积比1︰9混合而成的溶液;所述杂交缓冲溶液组成为:每L杂交缓冲溶液中含有2.42g Tris-HCl,1.46g EDTA,0.1g SDS,52.65g NaCl,0.3L甲酰胺,余量为水。

10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:步骤b中所述洗涤采用清洗缓冲溶液,所述清洗缓冲溶液组成为:每L清洗缓冲溶液中含有2.42g Tris-HCl,2.92g EDTA,0.1g SDS和18.02g NaCl,余量为水。

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