[发明专利]一种S-poly(T)PCR技术检测已知血液中表达的485miRNA的方法在审
申请号: | 201810251630.4 | 申请日: | 2018-03-26 |
公开(公告)号: | CN108456732A | 公开(公告)日: | 2018-08-28 |
发明(设计)人: | 李富荣;王勇;余涛;戴蘡璎;卫志坚 | 申请(专利权)人: | 深圳市展行生物有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 518000 广东省深圳市展行生物有限公*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 结直肠癌 检测 样本 验证 筛选 血液 息肉 健康人血浆 差异表达 临床诊断 异常表达 肿瘤位置 直肠 显著性 备选 初筛 非癌 复筛 病理 分析 肿瘤 健康 评估 | ||
1.一种S-poly(T)PCR技术检测已知血液中表达的485miRNA的方法,其特征在于:包括如下步骤:
1)初筛阶段:将结直肠癌53例以及健康人87例分别混合为一份进行筛选,利用S-poly(T)PCR技术,对已知血液中表达的485miRNA进行检测,分析筛选出存在显著性异常表达的miRNA;
2)复筛阶段:将此前53例结直肠癌样本按照TNM分期,将结直肠癌I-II期33例、结直肠癌III-IV期20例及健康人87例样本分别混合成一份,利用S-poly(T)PCR技术,对第一步中筛选出差异表达的miRNA进行检测,选出备选miRNA用于单个验证;
3)验证阶段:对48例结直肠癌、20例结直肠非癌性息肉、47例健康人血浆样本进行单个验证,分析各miRNA表达水平与病理分期、肿瘤大小、肿瘤位置等的相关性,评估miRNA对结直肠癌的临床诊断能力。
2.根据权利要求1的一种S-poly(T)PCR技术检测已知血液中表达的485miRNA的方法,其特征在于:所述初筛阶段对本院收集的53例结直肠癌、87例健康人分别做血浆混合样本,利用S-poly(T)PCR技术检测485个miRNA,按照以下标准:FC(fold change)>1或FC<-1、p<0.05,单个样本Ct值<35,筛选出显著差异的16种miRNA,其中2种miRNA上调,14种miRNA下调。
3.根据权利要求1的一种S-poly(T)PCR技术检测已知血液中表达的485miRNA的方法,其特征在于:所述复筛阶段利用S-poly(T)PCR技术检测16种miRNA,按照三组间均差异表达的标准,最终选定9种miRNA用于单个验证,其中8种miRNA下调表达,1种miRNA上调表达。
4.根据权利要求1的一种S-poly(T)PCR技术检测已知血液中表达的485miRNA的方法,其特征在于:所述验证阶段对48例结直肠癌、20例非癌性息肉、47例正常对照组血浆样本进行单个验证,结果显示:其中7种miRNA可显著区分结直肠癌与正常人:miR-27a-3p(t=6.11,p<0.00)、miR-144-3p(t=7.34,p<0.00)、miR-148a-3p(t=5.01,p<0.00)、miR-423-3p(t=6.48,p<0.00)、miR-424-5p(t=6.68,p<0.00)、miR-425-5p(t=7.74,p<0.00)、miR-1260b(t=4.87,p<0.00),此7种miRNA均为下调表达。
5.根据权利要求1的一种S-poly(T)PCR技术检测已知血液中表达的485miRNA的方法,其特征在于:所述验证阶段中结直肠癌组样本miR-27a-3p、miR-143-3p、miR-144-3p、miR-148a-3p、miR-423-3p、miR-424-5p、miR-425-5p、miR-483-5p、miR-1260b的FC采用2^-ΔΔCt值法(FC(fold change)=2^-ΔΔCt,ΔΔCt=ΔCt(CRC)–ΔCt(HC),ΔCt=AVG(targetmiRNA)–AVG(miR-54))计算。
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