[发明专利]与水稻高产相关的分支酸变位酶核苷酸序列及其应用

权利要求书

1.一种筛选高产水稻的方法，为方法甲或方法乙；

所述方法甲包括如下步骤：

（1）检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsCM3，存在OsCM3_a和OsCM3_b两种等位形式，所述OsCM3_a如序列表的序列1所示，所述OsCM3_b如序列表的序列2所示；

（2）进行如下判定：在邻近生长条件下，基因型为OsCM3_b纯合型的水稻群体的平均产量高于基因型为OsCM3_a纯合型的水稻群体的平均产量；

所述方法乙包括如下步骤：

（1）以待测水稻的基因组DNA为模板，采用特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsCM3_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsCM3_b纯合型；

所述特异引物对，由引物1和引物2组成；

所述引物1为序列表的序列3所示的单链DNA分子；

所述引物2为序列表的序列4所示的单链DNA；

（2）进行如下判定：在邻近生长条件下，基因型为OsCM3_b纯合型的水稻群体的平均产量高于基因型为OsCM3_a纯合型的水稻群体的平均产量。

2.一种高产水稻的筛选方法，为方法A或方法B；

所述方法A包括如下步骤：

（1）检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsCM3，存在OsCM3_a和OsCM3_b两种等位形式，所述OsCM3_a如序列表的序列1所示，所述OsCM3_b如序列表的序列2所示；

（2）进行如下判定：同等生长条件下，基因型为OsCM3_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsCM3_a纯合型的水稻群体的平均产量；

所述方法B包括如下步骤：

（1）以待测水稻的基因组DNA为模板，采用特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsCM3_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsCM3_b纯合型；

所述特异引物对，由引物1和引物2组成；

所述引物1为序列表的序列3所示的单链DNA分子；

所述引物2为序列表的序列4所示的单链DNA；

（2）进行如下判定：同等生长条件下，基因型为OsCM3_b纯合型的水稻群体的平均产量均高于基因型为OsCM3_a纯合型的水稻群体的平均产量。

3.一种水稻选育方法，为方法丙或方法丁；

所述方法丙包括如下步骤：

（1）检测待测水稻基于特异基因片段的基因型；所述特异基因片段位于水稻基因组中，为OsCM3，存在OsCM3_a和OsCM3_b两种等位形式，所述OsCM3_a如序列表的序列1所示，所述OsCM3_b如序列表的序列2所示；

（2）基因型为OsCM3_b纯合型的水稻为选育的目的水稻；

所述方法丁包括如下步骤：

（1）以待测水稻的基因组DNA为模板，采用特异引物对进行PCR扩增；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列1所示，则待测水稻的基因型为OsCM3_a纯合型；如果PCR扩增产物只有一种且如序列表中序列2所示，则待测水稻的基因型为OsCM3_b纯合型；

所述特异引物对，由引物1和引物2组成；

所述引物1为序列表的序列3所示的单链DNA分子；

所述引物2为序列表的序列4所示的单链DNA；

（2）基因型为OsCM3_b纯合型的水稻为选育的目的水稻。

4.DNA片段或特异引物对的应用，为如下（e1）或（e2）或（e3）或（e4）：

所述DNA片段，为OsCM3_b；

所述OsCM3_b为序列表的序列2所示的DNA分子；

所述特异引物对，由引物1和引物2组成；

所述引物1为序列表的序列3所示的单链DNA分子；

所述引物2为序列表的序列4所示的单链DNA；

（e1）筛选高产水稻；

（e2）筛选具有不同产量性状的水稻；

（e3）鉴定或辅助鉴定水稻的产量性状；

（e4）鉴定或辅助鉴定具有不同产量性状的水稻。

5.权利要求1-3中任一所述方法或权利要求4中所述DNA片段或权利要求4中所述特异引物对在高产水稻育种中的应用。