[发明专利]一种分析辣木亲缘关系的反应体系、试剂盒及其应用方法有效
申请号: | 201810189666.4 | 申请日: | 2018-03-08 |
公开(公告)号: | CN108456719B | 公开(公告)日: | 2022-03-29 |
发明(设计)人: | 林艺华;林宗铿;郑涛;蔡坤秀 | 申请(专利权)人: | 福建省热带作物科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人: | 李雁翔;游学明 |
地址: | 363000 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 分析 亲缘 关系 反应 体系 试剂盒 及其 应用 方法 | ||
1.一种分析辣木亲缘关系的SRAP分子标记引物组合,其特征在于:由如下13对引物对组成:
A6:5'-GACTGCGTACGAATTAAT-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TAG-3';
F1:5'-GACTGCGTACGAATT GCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG ATA-3';
F2:5'-GACTGCGTACGAATT GCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AGC-3';
F3:5'-GACTGCGTACGAATT GCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AAT-3';
G3:5'-GACTGCGTACGAATTATG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AAT-3';
I4:5'-GACTGCGTACGAATT ACG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG ACC-3';
L8:5'-GACTGCGTACGAATT GTC-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TGT-3';
M2:5'-GACTGCGTACGAATT GGT-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AGC-3';
M3:5'-GACTGCGTACGAATT GGT-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AAT-3';
P7:5'-GACTGCGTACGAATT CGG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TTG-3'
P8:5'-GACTGCGTACGAATT CGG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TGT-3'
Q1:5'-GACTGCGTACGAATT CCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG ATA-3'
Q2:5'-GACTGCGTACGAATT CCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AGC-3'。
2.辣木亲缘关系的分析方法,包括如下步骤:
(1)提取辣木基因组DNA为模板,保存于-20℃备用;
(2)采用PCR反应体系对(1)中的DNA进行扩增;所述反应体系中,每25µl反应液包含,不含Mg2+的10*PCR buffer 2.5µl,Mg2+ 2mM,dNTPs 0.2mM,DNA 40ng,Taq DNA聚合酶0.625U,上下游引物各0.75µmol;将所述反应液按如下程序进行扩增:94℃预变性5min,94℃变性1min,37℃复性1min,72℃延伸1min,5个循环反应,再94℃变性1min,50℃复性1min,72℃延伸1min,35个循环反应,72℃再延伸10min,4℃保存;其中,采用如下13对上下游引物分别扩增,分别是:
A6:5'-GACTGCGTACGAATTAAT-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TAG-3';
F1:5'-GACTGCGTACGAATT GCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG ATA-3';
F2:5'-GACTGCGTACGAATT GCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AGC-3';
F3:5'-GACTGCGTACGAATT GCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AAT-3';
G3:5'-GACTGCGTACGAATTATG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AAT-3';
I4:5'-GACTGCGTACGAATT ACG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG ACC-3';
L8:5'-GACTGCGTACGAATT GTC-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TGT-3';
M2:5'-GACTGCGTACGAATT GGT-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AGC-3';
M3:5'-GACTGCGTACGAATT GGT-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AAT-3';
P7:5'-GACTGCGTACGAATT CGG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TTG-3'
P8:5'-GACTGCGTACGAATT CGG-3';5'-TGAGTCCAAACCGG TGT-3'
Q1:5'-GACTGCGTACGAATT CCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG ATA-3'
Q2:5'-GACTGCGTACGAATT CCA-3';5'-TGAGTCCAAACCGG AGC-3';
(3)将扩增产物在2.0%琼脂糖凝胶上电泳,成像系统拍照保存;
(4)利用13对SRAP分子标记将不同品系辣木进行亲缘关系分析。
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