[发明专利]罗汉果性别基因SgACS2及其扩增方法在审
申请号: | 201810184464.0 | 申请日: | 2018-03-06 |
公开(公告)号: | CN108624595A | 公开(公告)日: | 2018-10-09 |
发明(设计)人: | 莫长明;郭文锋;李忠;张玉 | 申请(专利权)人: | 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12N15/10 |
代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 11369 | 代理人: | 靳浩 |
地址: | 530007 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 罗汉果 基因序列 性别基因 株系 基因工程育种 基因序列信息 多态性位点 品种遗传 性别鉴定 扩增 改良 检测 节约 进程 土地 开发 | ||
1.一种罗汉果性别基因SgACS2,其特征在于,雄株系该基因序列如SEQ ID No.1所示,雌株系该基因序列如SEQ ID No.2所示。
2.如权利要求1所述的罗汉果性别基因SgACS2的扩增方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一、采集罗汉果现蕾茎段,利用核酸纯化提取类试剂盒提取罗汉果的总RNA;
步骤二、利用反转录酶反转录步骤一所述的总RNA,反转录过程中加入接头引物,构建3'-RACE和5'-RACE cDNA模板库,利用DNA聚合酶进行PCR扩增,5'-RACE用接头引物和特异引物GST-F配对,得到5'-RACE-Ready cDNA,3'-RACE用接头引物和特异引物GST-R配对,得到3'-RACE-Ready cDNA,将PCR所得所有清晰片段进行回收纯化,与克隆载体连接处理并进行测序,经过生物信息分析软件拼接后得出罗汉果性别基因SgACS2全长cDNA序列如SEQ IDNo.3所示;
步骤三、在罗汉果性别基因SgACS2全长cDNA序列的非编码序列(UTR)上设计引物,利用核酸纯化提取类试剂盒提取罗汉果的总DNA,采用二引物法对提取的DNA进行PCR扩增,将PCR所得所有清晰片段进行回收纯化,与克隆载体连接处理并进行测序,经过生物信息分析软件拼接后得出罗汉果性别基因SgACS2全长DNA序列。
3.如权利要求2所述的罗汉果性别基因SgACS2的扩增方法,其特征在于,所述步骤二中,反转录过程中接头引物为5'-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGG–3',特异引物GST-F为ACAGCGTTTCTGAACTCTGGTAATC,特异引物GST-R为TGCTTCGCGAATATGGACGACAAGACG。
4.如权利要求2所述的罗汉果性别基因SgACS2的扩增方法,其特征在于,所述步骤二中,PCR扩增分为两次完成,第一次PCR扩增反应具体参数如下:25个循环,94度变性30秒、68度退火30秒、72度延伸3分钟,得到第一次RACE结果;第二次降落PCR扩增反应具体参数如下:5个循环,94度变性30秒、72度退火与延伸3分钟;5个循环,94度变性30秒、70度退火30秒、72度延伸3分钟;25个循环,94度变性30秒、68度退火30秒、72度延伸3分钟,得到第二次RACE结果。
5.如权利要求2所述的罗汉果性别基因SgACS2的扩增方法,其特征在于,所述步骤三中,二引物法中,特异引物序列如下所示:
SgACS2-F2:CACTGGAAAATATGGTGCTGGAATCG
SgACS2-R1:CGTTAAAACTTGGTCAGAATCGAACCC。
6.如权利要求2所述的罗汉果性别基因SgACS2的扩增方法,其特征在于,步骤三中PCR扩增反应具体参数如下:94度预变性5分钟;34个循环,94度变性30秒、59度退火30秒、72度延伸3分钟;72度延伸7分钟。
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