[发明专利]一种新的A/T到G/C碱基定点转换的基因编辑系统有效
| 申请号: | 201810142547.3 | 申请日: | 2018-02-11 |
| 公开(公告)号: | CN109306361B | 公开(公告)日: | 2022-06-28 |
| 发明(设计)人: | 李大力;张晓辉;谢玲;刘明耀 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学;上海邦耀生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/90 | 分类号: | C12N15/90;C12N9/22;C12N5/10 |
| 代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 王正君;徐迅 |
| 地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 碱基 定点 转换 基因 编辑 系统 | ||
1.一种在细胞内进行基因定点替换的方法,其特征在于,包括步骤:
(i) 提供一细胞以及第一载体和第二载体,其中所述第一载体含有第一核酸构建物,所述第二载体含有表达sgRNA的表达盒,
其中,所述第一核苷酸具有5’-3’(5’至3’)的式I结构:
P1-X1-L1-X2-X3 (I);
其中,P1为第一启动子序列;
X1为腺嘌呤脱氨酶的编码序列;
L1为无或连接序列;
X2为突变型Cas9核酸酶的编码序列,所述的Cas9核酸酶是无切割活性或单链切割活性的;所述Cas9核酸酶为含有突变位点D10A, E782K, N968K, R1015H 的saCas9n;
X3为polyA序列;
并且,各“-”独立地为键或核苷酸连接序列;
所述表达sgRNA的表达盒中的sgRNA为NNNRRT型sgRNA,并且所述sgRNA的第7、8和/或9位对应于预定发生高效A→G定点突变的位置,即为A;所述X2元件靶向的PAM序列为N1N2N3RRT,即N1, N2=A,T,C或G;N3=A, T, C或G;R=A或G;
(ii) 用所述的第一载体和第二载体感染所述的细胞,从而在所述细胞内进行基因定点替换。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一载体和/或第二载体还含有表达筛选标记的表达盒。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述筛选标记选自下组:绿色荧光蛋白、黄色荧光蛋白、红色荧光蛋白、或其组合。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述sgRNA的第8和/或9位对应于预定发生高效地A→G定点突变的位置,即为A。
5.一种核酸构建物,其特征在于,所述核酸构建物具有5’-3’(5’至3’)的式I结构:
P1-X1-L1-X2-X3 (I);
其中,P1为第一启动子序列;
X1为腺嘌呤脱氨酶的编码序列;
L1为无或连接序列;
X2为突变型Cas9核酸酶的编码序列,所述的Cas9核酸酶是无切割活性或单链切割活性的;所述Cas9核酸酶为含有突变位点D10A, E782K, N968K, R1015H的saCas9n;
X3为polyA序列;
并且,各“-”独立地为键或核苷酸连接序列;所述X2元件靶向的PAM序列为N1N2N3RRT,即N1, N2=A,T,C或G;N3=A, T, C或G;R=A或G。
6.如权利要求5所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一启动子选自下组: CMV启动子、CAG启动子、PGK启动子、或其组合。
7.如权利要求5所述的核酸构建物,其特征在于,所述腺嘌呤脱氨酶为串联型腺嘌呤脱氨酶,所述串联型腺嘌呤脱氨酶结构如式II所示:
Z1-L2-Z2 (II)
其中,
Z1为野生型腺嘌呤脱氨酶TadA的氨基酸序列;
L2为任选的连接肽序列;
Z2为突变型腺嘌呤脱氨酶TadA*的氨基酸序列。
8.一种载体组合,其特征在于,包括第一载体和任选的第二载体,所述第一载体含有权利要求5所述的核酸构建物,所述第二载体含有表达sgRNA的表达盒,所述表达sgRNA的表达盒中的sgRNA为NNNRRT型sgRNA,并且所述sgRNA的第7、8和/或9位对应于预定发生高效A→G定点突变的位置,即为A。
9.如权利要求8所述的载体组合,其特征在于,所述第一载体和/或第二载体还整合有筛选标记。
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