[发明专利]一种新的A/T到G/C碱基定点转换的基因编辑系统有效

专利信息
申请号: 201810142547.3 申请日: 2018-02-11
公开(公告)号: CN109306361B 公开(公告)日: 2022-06-28
发明(设计)人: 李大力;张晓辉;谢玲;刘明耀 申请(专利权)人: 华东师范大学;上海邦耀生物科技有限公司
主分类号: C12N15/90 分类号: C12N15/90;C12N9/22;C12N5/10
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司 31266 代理人: 王正君;徐迅
地址: 200241 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 碱基 定点 转换 基因 编辑 系统
【权利要求书】:

1.一种在细胞内进行基因定点替换的方法,其特征在于,包括步骤:

(i) 提供一细胞以及第一载体和第二载体,其中所述第一载体含有第一核酸构建物,所述第二载体含有表达sgRNA的表达盒,

其中,所述第一核苷酸具有5’-3’(5’至3’)的式I结构:

P1-X1-L1-X2-X3 (I);

其中,P1为第一启动子序列;

X1为腺嘌呤脱氨酶的编码序列;

L1为无或连接序列;

X2为突变型Cas9核酸酶的编码序列,所述的Cas9核酸酶是无切割活性或单链切割活性的;所述Cas9核酸酶为含有突变位点D10A, E782K, N968K, R1015H 的saCas9n;

X3为polyA序列;

并且,各“-”独立地为键或核苷酸连接序列;

所述表达sgRNA的表达盒中的sgRNA为NNNRRT型sgRNA,并且所述sgRNA的第7、8和/或9位对应于预定发生高效A→G定点突变的位置,即为A;所述X2元件靶向的PAM序列为N1N2N3RRT,即N1, N2=A,T,C或G;N3=A, T, C或G;R=A或G;

(ii) 用所述的第一载体和第二载体感染所述的细胞,从而在所述细胞内进行基因定点替换。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一载体和/或第二载体还含有表达筛选标记的表达盒。

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述筛选标记选自下组:绿色荧光蛋白、黄色荧光蛋白、红色荧光蛋白、或其组合。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述sgRNA的第8和/或9位对应于预定发生高效地A→G定点突变的位置,即为A。

5.一种核酸构建物,其特征在于,所述核酸构建物具有5’-3’(5’至3’)的式I结构:

P1-X1-L1-X2-X3 (I);

其中,P1为第一启动子序列;

X1为腺嘌呤脱氨酶的编码序列;

L1为无或连接序列;

X2为突变型Cas9核酸酶的编码序列,所述的Cas9核酸酶是无切割活性或单链切割活性的;所述Cas9核酸酶为含有突变位点D10A, E782K, N968K, R1015H的saCas9n;

X3为polyA序列;

并且,各“-”独立地为键或核苷酸连接序列;所述X2元件靶向的PAM序列为N1N2N3RRT,即N1, N2=A,T,C或G;N3=A, T, C或G;R=A或G。

6.如权利要求5所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一启动子选自下组: CMV启动子、CAG启动子、PGK启动子、或其组合。

7.如权利要求5所述的核酸构建物,其特征在于,所述腺嘌呤脱氨酶为串联型腺嘌呤脱氨酶,所述串联型腺嘌呤脱氨酶结构如式II所示:

Z1-L2-Z2 (II)

其中,

Z1为野生型腺嘌呤脱氨酶TadA的氨基酸序列;

L2为任选的连接肽序列;

Z2为突变型腺嘌呤脱氨酶TadA*的氨基酸序列。

8.一种载体组合,其特征在于,包括第一载体和任选的第二载体,所述第一载体含有权利要求5所述的核酸构建物,所述第二载体含有表达sgRNA的表达盒,所述表达sgRNA的表达盒中的sgRNA为NNNRRT型sgRNA,并且所述sgRNA的第7、8和/或9位对应于预定发生高效A→G定点突变的位置,即为A。

9.如权利要求8所述的载体组合,其特征在于,所述第一载体和/或第二载体还整合有筛选标记。

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