[发明专利]基于COX比例风险模型的十二指肠腺癌预后预测系统在审

专利信息
申请号: 201810092642.7 申请日: 2018-01-31
公开(公告)号: CN108389624A 公开(公告)日: 2018-08-10
发明(设计)人: 韩卫东;蒋苏静;谢建胜;赵荣杰;潘宏铭 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: G16H50/30 分类号: G16H50/30
代理公司: 杭州天正专利事务所有限公司 33201 代理人: 王兵;黄美娟
地址: 310027 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 十二指肠腺癌 预后预测 信息处理模块 生存率 存储器 风险模型 关系计算 预测结果 术后 显示器 风险因子 输出预测 求和 预存 配置
【权利要求书】:

1.基于COX比例风险模型的用于十二指肠腺癌患者术后预后预测系统,包括存储器和信息处理模块、预测结果显示器,其中,所述信息处理模块配置用于执行以下计算,并将计算结果与,所述的存储器预存的十二指肠腺癌术后预后预测指标进行比较,向预测结果显示器输出预测结果:

(I)根据以下关系计算各风险因子的分数:

(1)年龄分数:

年龄X小于等于58岁,分数为0;

年龄X在59岁至75岁之间,分数为31;

年龄X大于等于75,分数为70;

(2)肿瘤分化程度:

高分化,0分;

中分化,5分;

低分化,16分;

未分化,49分;

(3)肿瘤T分期:

T1,0分;

T2,54分;

T3,82分;

T4,100分;

(4)淋巴结转移:

无淋巴结转移,0分;

1-3个区域淋巴结转移,15分;

≥4个区域淋巴结转移,39分;

(5)远处转移:

无远处转移,0分;

有远处转移,44分;

(II)对(I)所获得的全部分数求和,计算得到总体分数Z;和

(III)根据以下关系计算患者3年生存率(Y3)或5年生存率(Y5):

如下计算3年生存率:

总体分数Z≤40分,则3年生存率Y3≥90%;

40<总体分数Z<213分,则3年生存率Y3=1.192-Z/200;

总体分数≥213,则3年生存率Y3<10%;

如下计算5年生存率:

总体分数Z≤25分,则5年生存率Y5≥90%;

97<总体分数Z<17分,则5年生存率Y5=1.116-Z/200;

总体分数Z>197分,则59年生存率Y5<10%。

2.如权利要求1所述的基于COX比例风险模型的用于十二指肠腺癌患者术后预后预测系统,其特征在于:还包括一个十二指肠腺癌术后预后预测指标构建模块,十二指肠腺癌术后预后预测指标构建模块包括:

数据收集子模块:在SEER数据库中,通过Perl程序抓取得到十二指肠腺癌数据,对十二指肠腺癌数据进行筛选,并对筛选结果进行下载和提取;

数据预处理子模块:与所述数据收集子模块相连,用于对高通量数据进行预处理,包括缺失删除,使用特征二值化进行标准化处理,使用Excel表进行数据汇总;得到预处理后数据;

数据转换子模块:与所述筛选子模块相连,用于对十二指肠腺癌术后预后不良的数据集进行,随机分配,形成训练数据集和内部验证数据集;

特征筛选子模块:对训练数据集进行特征筛选,选出使预测准确度达到最高的最少特征的集合,即用于模型构建的特征集合;所述特征筛选为:使用SPSS程序中的COX比例风险模型,构造特征排序系数,每次迭代去掉一个排序系数最小的特征,最终得到所有特征的递减排序;选出使预测准确度达到最高的最少特征的集合,即用于十二指肠腺癌术后预后预测指标建立的特征集合;预后相关因素判定标准为:死亡组与存活组的临床特征预后相关性的P值<0.05的因素;

指标建立子模块:使用所述特征集合和训练数据集,采用COX回归模型,使用R程序中的cph程序包构建十二指肠腺癌术后预后预测指标。

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