[发明专利]不同体积数字PCR定量分析方法在审
| 申请号: | 201810070368.3 | 申请日: | 2018-01-24 |
| 公开(公告)号: | CN110066856A | 公开(公告)日: | 2019-07-30 |
| 发明(设计)人: | 盛广济 | 申请(专利权)人: | 思纳福(北京)医疗科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 北京华进京联知识产权代理有限公司 11606 | 代理人: | 赵永辉 |
| 地址: | 100094 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 数字PCR 定量分析 核酸扩增反应 置信区间 标准差 微液滴 检测 个数量级 耗材成本 起始拷贝 核酸 获知 | ||
通过不同体积数字PCR的定量分析方法,可以获得的ln(c)相应的标准差σ以及置信区间。通过ln(c)相应的标准差σ以及置信区间可以得到待测核酸扩增反应液的核酸浓度为c,因此也可以获知所述待测核酸扩增反应液中含有的DNA起始拷贝数目。所述不同体积数字PCR的定量分析方法可以利用少于200个微液滴实现5个数量级的检测动态范围,提高了数字PCR检测仪器的检测动态范围。并且,其性能可以和拥有12000个微液滴的单一体积数字PCR相媲美,节省了仪器的成本,耗材成本降低。
技术领域
本发明涉及数字PCR定量分析领域,特别是涉及一种不同体积数字PCR定量分析方法。
背景技术
数字PCR(Digital PCR,dPCR)是一种核酸分子绝对定量技术。相较于qPCR,数字PCR可让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的绝对定量。定量PCR是依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,而数字PCR则让你能够直接数出DNA分子的个数,是对起始样品的绝对定量。但是,目前数字PCR定量检测无论是微孔式还是液滴式的数字PCR技术,采用的都是是单一体积数字PCR技术。
单一体积数字PCR的定量上限主要取决于反应单元的体积和数量,检测下限与样本总体积相关。单一体积数字PCR的定量分析方法需要连续对待测核酸扩增反应液进行稀释,增加了试剂的用量和交叉污染的风险,操作步骤繁琐。因此,单一体积数字PCR的定量分析方法缩小了数字PCR检测仪器的检测动态范围,从而无法提高检测灵敏度。
发明内容
基于此,有必要针对单一体积数字PCR的定量检测方法灵敏度低的问题,提供一种检测动态范围大的的不同体积数字PCR定量分析方法。
本发明提供一种不同体积数字PCR的定量分析方法,包括:
S4310:获取所有微液滴体积v1,v2,...vm,所述体积为v1,v2,...vm依次对应的微液滴的数目n1,n2,…,nm,以及所述体积为v1,v2,...vm依次对应的微液滴核酸扩增后的阴性微液滴数目b1,b2,…,bm;
S4320:根据所有微液滴核酸扩增后的相关参数v1、v2,...vm,n1,n2,…,nm,b1,b2,…,bm,构建关于待测核酸扩增反应液浓度c的联合二项分布函数f(c);
S4330:根据联合二项分布函数f(c),求使得所述联合二项分布函数f(c)取极值时c的值;
S4340:将所述联合二项分布函数f(c)转化为关于ln(c)的联合二项分布函数F(Λ),获得关于ln(c)的标准差以及置信区间;
S4350:根据ln(c)的标准差以及置信区间,获取所述待测核酸扩增反应液浓度c的标准差以及置信区间。
在其中一个实施例中,所述S4310包括:
S4311:将含有目标核酸的样品溶液微滴化,获得多个不同体积v1,v2,...vm的微液滴,所述微液滴体积为v1,v2,...vm依次对应的微液滴的数目n1,n2,…,nm;
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