[发明专利]不同体积数字PCR定量分析方法在审
| 申请号: | 201810070368.3 | 申请日: | 2018-01-24 |
| 公开(公告)号: | CN110066856A | 公开(公告)日: | 2019-07-30 |
| 发明(设计)人: | 盛广济 | 申请(专利权)人: | 思纳福(北京)医疗科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 北京华进京联知识产权代理有限公司 11606 | 代理人: | 赵永辉 |
| 地址: | 100094 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 数字PCR 定量分析 核酸扩增反应 置信区间 标准差 微液滴 检测 个数量级 耗材成本 起始拷贝 核酸 获知 | ||
1.一种不同体积数字PCR的定量分析方法,其特征在于,包括:
S4310:获取所有微液滴体积v1,v2,...vm,所述体积为v1,v2,...vm依次对应的微液滴的数目n1,n2,…,nm,以及所述体积为v1,v2,...vm依次对应的微液滴核酸扩增后的阴性微液滴数目b1,b2,…,bm;
S4320:根据所有微液滴核酸扩增后的相关参数v1、v2,...vm,n1,n2,…,nm,b1,b2,…,bm,构建关于待测核酸扩增反应液浓度c的联合二项分布函数f(c);
S4330:根据联合二项分布函数f(c),求使得所述联合二项分布函数f(c)取极值时c的值;
S4340:将所述联合二项分布函数f(c)转化为关于ln(c)的联合二项分布函数F(Λ),获得关于ln(c)的标准差以及置信区间;
S4350:根据ln(c)的标准差以及置信区间,获取所述待测核酸扩增反应液浓度c的标准差以及置信区间。
2.如权利要求1所述的不同体积数字PCR的定量分析方法,其特征在于,所述S4310包括:
S4311:将含有目标核酸的样品溶液微滴化,获得多个不同体积v1,v2,...vm的微液滴,所述微液滴体积为v1,v2,...vm依次对应的微液滴的数目n1,n2,…,nm;
S4313:将所有微液滴进行核酸扩增,并拍照检测,获得所述所有微液滴的荧光图像;
S4315:根据所述所有微液滴的荧光图像,获取所述所有微液滴的体积为v1,v2,...vm依次对应的核酸扩增后的阴性微液滴数目b1,b2,…,bm。
3.如权利要求1所述的不同体积数字PCR的定量分析方法,其特征在于,所述S4310还包括:
S4312:将含有目标核酸的样品溶液微滴化,形成多个微液滴;
S4314:将所述多个微液滴进行核酸扩增,并拍照检测,获得所有微液滴核酸扩增后的荧光图像;
S4316:根据所述荧光图像,获取所述所有微液滴核酸扩增后的体积,所述体积分别为v1,v2,...vm,所述体积分别为v1,v2,...vm依次对应的核酸扩增后的微液滴的数目n1,n2,…,nm,以及所述体积为v1,v2,...vm依次对应的核酸扩增后的阴性微液滴数目b1,b2,…,bm。
4.如权利要求1所述的不同体积数字PCR的定量分析方法,其特征在于,所述S4320构建关于待测核酸扩增反应液浓度c的联合二项分布函数f(c)为:
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