[发明专利]基于分子标签和二代测序降低测序错误的测序方法、试剂盒及其应用在审
| 申请号: | 201810067545.2 | 申请日: | 2018-01-24 |
| 公开(公告)号: | CN108148900A | 公开(公告)日: | 2018-06-12 |
| 发明(设计)人: | 于丹;姚旭梅;涂小年;李小花;刘朝煜 | 申请(专利权)人: | 深圳因合生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 深圳市徽正知识产权代理有限公司 44405 | 代理人: | 李想 |
| 地址: | 518000 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 测序 模板DNA 样本 富集 扩增 分子标签 特异序列 有效识别 标签 试剂盒 突变 漂移 退火 标签测序 接头连接 接头引物 扩增产物 有效解决 原始模板 回收 双链DNA 不对称 上接头 补平 单端 反链 双端 正链 应用 并用 合成 引入 | ||
1.一种基于分子标签和二代测序降低测序错误的测序方法,其特征在于,所述测序方法包括如下步骤:
S1.针对不同样本,合成4-16种含有不同固定特异序列标签的接头的正链P5和反链P7,将各种接头的P5和P7进行退火,形成4-16种Y字型接头;
S2.将模板DNA进行末端补平,并在补平后的3’端添加A碱基;
S3.将4-16种Y字型接头连接到步骤S2处理后的模板DNA的两端;
S4.回收连接上接头的模板DNA,并用带有样本标签的接头引物对回收的模板DNA进行富集扩增;
S5.回收经步骤S4富集扩增的产物;
S6.对富集扩增产物进行二代测序。
2.根据权利要求1所述的测序方法,其特征在于,所述固定特异序列标签位于P5的3’端,所述固定特异序列标签的反向互补序列位于P7的5’端。
3.根据权利要求1所述的测序方法,其特征在于,所述4-16种含有不同固定特异序列标签的接头是等分子浓度混合,其中,所述固定特异序列标签由2-10个碱基组成。
4.根据权利要求1所述的测序方法,其特征在于,每个样本含有特定的4-16种不同固定特意序列标签,各个样本间的固定特意序列标签是不同的。
5.根据权利要求2所述的测序方法,其特征在于,P5为如SEQ ID NO.1所示的脱氧核苷酸序列,所述P7为如SEQ ID NO.2所示的脱氧核苷酸序列。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤S4中带有样本标签的接头引物包括正向引物和反向引物,所述正向引物为如SEQ ID NO.3所示的脱氧核苷酸序列,所述反向引物为如SEQ ID NO.4所示的脱氧核苷酸序列。
7.一种实现如权利要求1-6任一项所述的测序方法的试剂盒,其特征在于,包括接头、接头连接试剂、扩增连接产物的接头引物、核酸富集磁珠。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述接头为P5序列和P7序列退火形成,所述P5为如SEQ ID NO.1所示的脱氧核苷酸序列,所述P7为如SEQ ID NO.2所示的脱氧核苷酸序列。
9.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,扩增连接产物的接头引物包括正向引物和反向引物,所述正向引物为如SEQ ID NO.3所示的脱氧核苷酸序列,所述反向引物为如SEQ ID NO.4所示的脱氧核苷酸序列。
10.如权利要求1-6中任一项所述的测序方法的应用,其特征在于,所述测序方法可单独或者与探针捕获技术结合应用于基因突变检测,或者应用于微生物多样性测序、种群多样性分析或功能基因的多样性分析。
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