[发明专利]克柔念珠菌STR分子标记及其应用有效
| 申请号： | 201810060340.1 | 申请日： | 2018-01-22 |
| 公开（公告）号： | CN108103229B | 公开（公告）日： | 2021-09-07 |
| 发明（设计）人： | 肖盟;单小云;龚杰;范欣;徐英春;张建中;何利华;王贺 | 申请（专利权）人： | 中国医学科学院北京协和医院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京驰纳智财知识产权代理事务所(普通合伙) 11367 | 代理人： | 单晶 |
| 地址： | 100730 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 念珠菌 str 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种克柔念珠菌STR分子标记或STR分子标记组合的检测方法，其特征在于，所述STR分子标记为SEQ ID NO:1-40所示序列中的任一个，所述STR分子标记组合为SEQ ID NO:1-40所示序列中的任意两个或多个组合，
包括以下步骤：
(1)提取克柔念珠菌的基因组DNA；
(2)合成SEQ ID NO:41-120所示的引物，并使用荧光染料对正向引物5'端进行标记，获得荧光标记的引物组；
(3)以步骤(1)提取的基因组DNA为模板，利用步骤(2)荧光标记的引物组进行PCR扩增；
(4)对扩增产物中的单色荧光标记DNA片段进行多态性检测。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(3)采用的PCR反应体系为：2×PremixTaq 10ul，10uM正、反向引物各1ul，纯水7ul，DNA模板1ul；
PCR程序为：95℃ 5min；95℃ 30sec，56-62℃ 30sec，72℃ 40sec，33个循环；72℃5min。
3.非诊断目的克柔念珠菌检测方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)提取待测样品DNA；
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板，利用SEQ ID NO:41-120所示的引物进行PCR扩增；
(3)分析PCR扩增产物。
4. 根据权利要求1或2所述STR分子标记或分子标记组合的检测方法在克柔念珠菌的分子分型、分子溯源、 群体遗传学和系统进化分析中的应用。
5.用于执行权利要求1或2中克柔念珠菌STR分子标记或STR分子标记组合的检测方法的试剂盒。
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