[发明专利]一种特异性靶向hDGKθ基因的荧光素酶报告系统有效
申请号: | 201810054844.2 | 申请日: | 2018-01-19 |
公开(公告)号: | CN108359692B | 公开(公告)日: | 2022-03-15 |
发明(设计)人: | 夏海滨;单琳琳;张伟锋;赵俊丽 | 申请(专利权)人: | 陕西师范大学 |
主分类号: | C12N15/90 | 分类号: | C12N15/90;C12N9/22 |
代理公司: | 西安恒泰知识产权代理事务所 61216 | 代理人: | 李郑建 |
地址: | 710062 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 特异性 靶向 hdgk 基因 荧光 报告 系统 | ||
1.一种特异性靶向hDGKθ基因的荧光素酶报告系统的建立方法,其特征在于,按下列步骤进行:
(1)筛选靶向hDGKθ基因3′非编码区的sgRNA
从NCBI查找hDGKθ基因的基因组序列,在位于终止密码子之后的非编码区选择四个sgRNA结合位点并设计相应的sgRNA引物,将sgRNA引物退火后连接到Cas9表达载体,转染HEK293细胞,转染72小时后,提取基因组DNA,对打靶区域进行PCR扩增,利用T7E1法筛选具有最高切割活性的sgRNA;
(2)构建携带Cas9和靶向hDGKθ基因的sgRNA的打靶载体
将筛选获得的靶向DGKθ基因的sgRNA表达元件、Cas9表达元件依次连入真核表达载体,获得pCas9-DGKθsgRNA;
(3)构建携带上下游同源臂及外源DNA片段的打靶供体
以人源化细胞基因组为模板,PCR扩增上、下游同源臂,依次连入携带T2A-LuciferasecDNA-CMV-eGFP-T2A-Neomyci-SV40pA元件的表达载体的两端;
(4)将打靶载体与打靶供体共同导入细胞,用筛选基因筛选,将筛选稳定后的细胞进行克隆化,对克隆化后的细胞克隆进行测序鉴定;
其中:所述的四个sgRNA结合位点分别为:
SgRNA1:CCCGCCCTCATCCCATTGGTGA,
SgRNA2:TGTTACCCCGTGTCCCGGGTGGG,
SgRNA3:TGATCTCACTTTGTGCCCCTCGG,和
SgRNA4:CTGGTGACTTCCTTGTGTTCAGG;
所述的上游同源臂的序列如下所示:
ACACCAGGTTTGAGAAGCCACGCATGGACGACGGGCTGCTGGAG GTTGTGGGCGTGACGGGCGTCGTGCACATGGTGAGCCGCCGGCCGAGTGGGCGGGCGAGCCCAGGGTGGGCGTCCCCGGTCCCCGCTGAGCCCAGCTGGCCTCTCCCGCCCCAGGGCCAGGTCCAGGGTGGGCGTCCCCGGTCCCCGCTGAGCCCGGCTGGCCTCTCCCGCCCCAGGGCCAGGTCCAGGGTGGGCGTCCCTGGTCCCTGCTCGGCTGGCCTCTCCCGCCCCAGGGCCAGGTCAGCGGTGGGCGTCCCTGATCCCCGCTGAGCCCGGCTGGCCTCTCCCGCCCCAGGGCCAGGTCCAGGGTGGGCTGCGCTCCGGAATCCGGATTGCCCAGGGTTCCTACTTCCGAGTCACGCTCCTCAAGGCCACCCCGGTGCAGGTGGACGGGGAGCCCTGGGTCCAGGCCCCGGGGCACATGATCATCTCAGCTGCTGGCCCTAAGGTATGTGGGGTGAGGCTGGAGAGCCAGGGGAGGTGGGCCGGGCTGGGCCGGCCATGGGAGTGGCCAGTGGTACCCAGGTGGTGCTGGCATGGCCGGCTGCGGCCAGGGAGCACTGACTCCGGGAGGGTGCCTGCTTCAGAGGAGGGCTGTGCCAGTGGCCAGGCGGGCCACAGGTGGCACAGGGAGCAGCCAGACAGGTCCCTCCCCTTCCGTGAAATGGGGCTGAGATGGCATCAGCTGCCCGGGGCCCCAGGACCGGGGGCTGCCCGTGTACCGTTCTTTCATCGGCCATGTCACCCTGGTCCTCTGTCCCCTGCCCTGGGACAGGTGCACATGCTGAGGAAGGCCAAGCAGAAGCCGAGGAGGGCCGGGACCACCAGGGATGCCCGGGCGGATGCTGCGCCTGCCCCTGAGAGCGATCCTAGG;
所述下游同源臂的序列如下所示:
AGGCTAGGAGGTCTCAGGTGCTGCCCTGGCAGCACCAGAGTGTGGGCCGGGCCCGAGTGTCTGCCCCTCGGCCCTCAGGGTGGGGCACTTAGCACCCAGAAGGGACCAAAAGCAGGGCATGGCGGTGCAGAGGAGTTTGGGAGGTGTAAACAGCCCATGCACGTGGAGGAGGAGCTGGCTTTCAGCCCCAGACCCCACGCTAGCACTTTCCACGCTGCTTGCCCGCTGTTGATGT GCAGTTCCCAGTGCCTGTGTGAGCCGACATCTGCTCAGTCCTATCCCTCGTCAGCGTGTGGAGACCCAGCTCCTGCAGCCCTCCTGCTCCCACGCCCCCAGACAGCTTGGTGGAGGGTCCTGCATCTGGGCCAGGCTGGGGTGCACCCAGCCAAAGACAAAGCTGCCTCCACGTGCCCAAGGATTCAGATGGTGCACTGGCCCCGGGAGGAGTCTGACCAAAAATGGAGCCCGCTCTGTGGGGAAGCCCCGACTCCCCCACGAGAAACGGTCCCACGGTGCGGATCTCCCCCTTCCCTTGTGGGGCACAGCTGGCCTGGGCCTCCAATCCTGCGGAGCTTTCCTGGGTGTGGCTTTGACCTCAGAAGTGGCTCTGGTTTGGCCTCAGGAGTGTGGCCTGGCCCAGCCTGCTGCAGCCTCCTGGGGGGCCCTTGATGCCACTAATCCCCCGACCCCCCGCATCTGCCAAACTGCACAGACACACG;
利用所述建立方法构建的特异性靶向hDGKθ基因的荧光素酶报告系统,荧光素酶基因可以被定点整合到hDGKθ基因下游,在自剪切小肽介导下,与hDGKθ基因同时受hDGKθ启动子转录起始,实现了荧光素酶活性与内源性靶基因hDGKθ活性直接相关;从而能够筛选对DGKθ基因具有转录调控作用的上游转录因子或者小分子药物;能促进hDGKθ在相关的神经系统性疾病及代谢性疾病治疗中作为潜在靶标的研究。
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