[发明专利]一种用于急性髓系白血病药物指示的方法及装置

说明书

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，尤其涉及一种用于急性髓系白血病药物指示的方法及装置。

背景技术

急性髓性白血病(AML，Acute Myeloid Leukemia)是一种以造血干细胞分化受阻导致不同阶段未成熟细胞异常增殖而正常造血组织减少为特征的恶性克隆性疾病，严重影响人类的健康。

根据细胞遗传学分层可将AML预后分为低危组、中危组和高危组，其中，被划分在中危组的核型正常的(CN-AML，Cytogenetically normal Acute Myeloid Leukemia)患者约占全部AML患者50％，这类患者存在明显异质性，预后存在明显差异。

目前可在CN-AML患者中检测到分子遗传学的变化，包括与CN-AML预后相关的基因突变和基因表达的改变，然后利用分子遗传学并结合联用多项临床指征，比如：基因突变、患者年龄、细胞遗传学水平及基因表达等进行联合打分可以实现CN-AML患者的预后评估。但是这种评估方法的过程非常繁琐，且不能有效地进行预后评估的疾病分层，更不能对相应层级的患者指示对应的药物信息，导致临床不能根据相应的药物指示信息尽快制定治疗方案，延误治疗时机。

发明内容

针对现有技术存在的问题，本发明实施例提供了一种用于正常核型急性髓系白血病药物指示的方法及装置，用于解决现有技术中不能有效、简易地对CN-AML患者进行预后评估和疾病分层，且不能对相应层级的患者指示对应的药物信息，导致临床不能根据相应的药物指示快速制定治疗方案，延误治疗时机的技术问题。

本发明提供一种用于急性髓系白血病药物指示的方法，所述方法包括：

获取正常核型急性髓系白血病CN-AML患者的目标评估基因，所述目标评估基因为STAB1基因；

根据CN-AML患者目标评估基因的基因表达量对所述CN-AML患者进行分层，将所述CN-AML患者分为预后良好组及预后不良组；

对处于预后不良组的CN-AML患者指示相应的药物信息。

上述方案中，所述根据CN-AML患者目标评估基因的基因表达量对所述CN-AML患者的预后生存时间进行分层，包括：

获取所述目标评估基因在目标样本中的各基因表达量；

确定各基因表达量的中位数；

当所述CN-AML患者目标评估基因的基因表达量大于所述中值时，确定所述CN-AML患者的目标评估基因为高表达基因，将所述当前CN-AML患者分为预后不良组；

当所述CN-AML患者目标评估基因的基因表达量小于所述中值时，确定所述CN-AML患者的目标评估基因为低表达基因，将所述当前CN-AML患者分为预后良好组。

上述方案中，所述对处于预后不良组的CN-AML患者指示相应的药物信息，包括：

获取对目标药物敏感或耐药的基因以及癌症药物数据库中多个药物的拮抗剂的半抑制浓度IC50值，所述目标药物为临床上的经验药物；

利用皮尔森函数确定所述STAB1基因的表达量与所述对药物敏感或者耐药的基因表达量之间的相关性，若所述STAB1基因的表达量与所述对药物敏感或者耐药的基因表达量之间的相关性为正相关，则将所述目标药物作为处于预后不良组的CN-AML患者的指示药物；

利用所述皮尔森函数确定癌症药物数据库中的药物拮抗剂的半抑制浓度IC50值与所述STAB1基因表达量的相关性，若所述IC50值与所述STAB1基因表达量的呈正相关性，则将所述药物作为处于预后不良组的CN-AML患者的指示药物。

上述方案中，所述对处于预后不良组的CN-AML患者指示相应的药物信息，包括：

对处于预后不良组的CN-AML患者指示阿糖胞苷药物、小分子抑制剂NVP-BHG712、小分子抑制剂GSK-J4、小分子抑制剂BRD-K30748066和陶扎塞替Tozasertib药物信息。

上述方案中，所述方法包括：

从数据库中获取目标样本的基因表达信息，所述目标样本为正常核型急性髓系白血病CN-AML患者的样本；

根据预设的生存时间为分类标准，将所述目标样本分为第一类样本及第二类样本，所述第一类样本为生存时间小于2年的样本，所述第二类样本为生存时间大于2年的样本；

根据预设的第一筛选条件对所述第一类样本及所述第二类样本的基因进行筛选，获取多个差异表达基因；

根据预设的第二筛选条件对所述多个差异表达基因进行筛选，获取与所述生存时间相关的多个预后相关差异表达基因；