[发明专利]一种用于急性髓系白血病药物指示的方法及装置

权利要求书

1.一种用于急性髓系白血病药物指示的方法，其特征在于，所述方法包括：

获取正常核型急性髓系白血病CN-AML患者的目标评估基因，所述目标评估基因为STAB1基因；

根据CN-AML患者目标评估基因的基因表达量对所述CN-AML患者进行分层，将所述CN-AML患者分为预后良好组及预后不良组；

对处于预后不良组的CN-AML患者指示相应的药物信息。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据CN-AML患者目标评估基因的基因表达量对所述CN-AML患者的预后生存时间进行分层，包括：

获取所述目标评估基因在目标样本中的各基因表达量；

确定各基因表达量的中位数；

当所述CN-AML患者目标评估基因的基因表达量大于所述中值时，确定所述CN-AML患者的目标评估基因为高表达基因，将所述当前CN-AML患者分为预后不良组；

当所述CN-AML患者目标评估基因的基因表达量小于所述中值时，确定所述CN-AML患者的目标评估基因为低表达基因，将所述当前CN-AML患者分为预后良好组。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对处于预后不良组的CN-AML患者指示相应的药物信息，包括：

获取对目标药物敏感或耐药的基因以及癌症药物数据库中多个药物的拮抗剂的半抑制浓度IC50值，所述目标药物为临床上的经验药物；

利用皮尔森函数确定所述STAB1基因的表达量与所述对药物敏感或者耐药的基因表达量之间的相关性，若所述STAB1基因的表达量与所述对药物敏感或者耐药的基因表达量之间的相关性为正相关，则将所述目标药物作为处于预后不良组的CN-AML患者的指示药物；

利用所述皮尔森函数确定癌症药物数据库中的药物拮抗剂的半抑制浓度IC50值与所述STAB1基因表达量的相关性，若所述IC50值与所述STAB1基因表达量的呈正相关性，则将所述药物作为处于预后不良组的CN-AML患者的指示药物。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对处于预后不良组的CN-AML患者指示相应的药物信息，包括：

对处于预后不良组的CN-AML患者指示阿糖胞苷药物、小分子抑制剂NVP-BHG712、小分子抑制剂GSK-J4、小分子抑制剂BRD-K30748066和陶扎塞替Tozasertib药物信息。

5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法包括：

从数据库中获取目标样本的基因表达信息，所述目标样本为正常核型急性髓系白血病CN-AML患者的样本；

根据预设的生存时间为分类标准，将所述目标样本分为第一类样本及第二类样本，所述第一类样本为生存时间小于2年的样本，所述第二类样本为生存时间大于2年的样本；

根据预设的第一筛选条件对所述第一类样本及所述第二类样本的基因进行筛选，获取多个差异表达基因；

根据预设的第二筛选条件对所述多个差异表达基因进行筛选，获取与所述生存时间相关的多个预后相关差异表达基因；

从所述数据库中获取影响所述CN-AML预后的临床因子，根据影响所述CN-AML预后的临床因子及影响急性髓系白血病AML生存的经验预后因子对所述多个预后相关差异表达基因进行多因素比例风险Cox回归分析，获取各独立预后基因；

根据预设的验证样本集分别对每个独立预后基因进行验证，根据验证结果确定出所述目标评估基因。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述从数据库中获取目标样本的基因表达信息，包括：

从癌症基因数据库TCGA中获取预设数量样本的基因表达信息；

根据目标样本的样本标识，从所述预设数量样本中提取目标样本的基因表达信息。

7.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述根据预设的第一筛选条件对所述第一类样本及所述第二类样本的基因进行筛选，获取多个差异表达基因，包括：

根据所述第一筛选条件对所述第一类样本中的所有基因及所述第二类样本中的所有基因进行筛选，获取多个所述差异表达基因；其中，所述第一筛选条件为假阳性基因的假阳性率FDR<0.05且基因的差异倍数fold-change>1.5。