[发明专利]通过细菌宏基因组分析来诊断前列腺疾病的方法

说明书

本发明涉及通过细菌宏基因组学分析诊断如前列腺癌、前列腺增生等前列腺疾病的方法，更具体涉及通过执行用源自受试者的样品的细菌宏基因组分析，且分析源自特定细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少来诊断前列腺癌或前列腺增生的方法。从环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡可被吸收到体内并直接影响炎症和癌症的发生，且在任何症状出现之前很难早期诊断前列腺癌、前列腺增生等前列腺疾病，这使得有效治疗变得困难。因此，根据本发明通过用源自人体的样品对存在于源自细菌的细胞外囊泡中的基因的宏基因组分析，可预先预测前列腺癌和前列腺增生的发病风险，从而能提前诊断和预测前列腺疾病风险组，及经适当护理延迟发病时间或预防发病，即使在前列腺癌和前列腺增生发病后仍可进行早期诊断，这可降低前列腺疾病的发病率并提高治疗效果。

技术领域

本公开涉及用于通过细菌的宏基因组分析来诊断前列腺疾病，例如前列腺癌、前列腺增生等的方法，更具体地，涉及经由使用来源于受试者的样品的细菌的宏基因组分析，通过分析来源于特异性细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来诊断前列腺疾病的方法。

背景技术

前列腺是男性生殖器官的一部分，其是产生用于通过与精子混合以产生精液的液体的器官。前列腺增生是一种病症，这种病症使前列腺增大，从而阻断让膀胱下部尿液排出的路径，导致尿道尿流阻塞或减少，并且良性前列腺增生(BPH)是一种男性排尿障碍，其是一种由于前列腺肿大引起排尿困难的疾病。前列腺围绕管(尿道)，尿液从膀胱传送通过尿道，并在青春期均匀扩张，随着年龄的增长，BPH通过集中在腺体的尿道侧向部分而发展。尚未清楚地发现良性前列腺增生的原因，但已知各种因素与其他慢性疾病一样起作用。由于前列腺是雄性激素依赖性器官，因此不断需要雄性激素来维持生长和功能，当通过阉割不产生雄性激素时，前列腺会收缩，并且已知前列腺增生与遗传因素、家族史等相关。

前列腺癌是在前列腺中发展的恶性肿瘤，并且在大多数情况下是在前列腺细胞中发生的腺癌(腺细胞癌)。前列腺癌的危险因素在年龄较大(50岁或以上)时迅速增加。根据种族，亚洲人的发病率最低，遗传易感性、家族史、雄性激素、糖尿病、肥胖、西化饮食(动物脂肪摄入量增加)、感染等被认为是危险因素。虽然没有明确证据表明早期体检可以预防因前列腺癌导致的死亡，但一般建议年龄在50岁或以上的预期寿命超过10年的男性每年接受血液(血清)前列腺特异性抗原(PSA)测试和直肠指检。然而，尽管在现代西方医学中取得了很大进展，但仍然没有使用非侵入性方法预测前列腺癌的方法，并且在许多情况下，使用现有的诊断方法在发育后检测诸如前列腺癌等实体癌症。因此，通过预测前列腺癌的发病和致病因素，提供一种预防高风险组中前列腺癌发病以降低医疗费用和预防由前列腺癌引起的死亡的方法是有效的。

同时，众所周知，在人体内共生的微生物数量为100万亿，是人类细胞数的10倍，微生物的基因数超过人类基因数的100倍。微生物群(microbiota)或微生物菌群(microbiome)是一个微生物群落，其中包括在给定栖息地中存在的细菌、古细菌和真核生物，并且已知肠道微生物群在人类的生理现象中起着至关重要的作用，并通过与人类细胞的相互作用对人体健康和疾病产生重大影响。共生地生活在人体内的细菌分泌纳米级的囊泡，以便与其他细胞交换关于基因、蛋白质等的信息。呼吸道和胃肠粘膜形成不允许尺寸为200nm或以上的粒子通过的物理阻隔膜，因此共生在粘膜中的细菌不能通过，但来源于细菌的细胞外囊泡具有大约为100nm或以下的尺寸，因此相对自由地通过粘膜并被吸收到人体内。

宏基因组学(也称为环境基因组学)可以是针对从自环境中收集的样品获得的宏基因组数据的分析学(韩国专利公开No.2011-0073049)。最近，使用基于16s核糖体RNA(16srRNA)碱基序列的方法列出了人类微生物群的细菌组成，并且使用下一代测序(NGS)平台分析了16s rDNA碱基序列，其是16s核糖体RNA的基因。

然而，在诸如前列腺增生、前列腺癌等前列腺疾病的发作中，从未报道过，通过从人类来源的物质(例如尿等)中分离的来源于细菌的囊泡的宏基因组分析来鉴定前列腺疾病的致病因素，以及诊断发展前列腺疾病风险的方法

发明内容