[发明专利]辨识转移性肿瘤的原发位置的方法及系统在审

专利信息
申请号: 201780061778.5 申请日: 2017-10-27
公开(公告)号: CN109844140A 公开(公告)日: 2019-06-04
发明(设计)人: 黄培瑛 申请(专利权)人: 茂英基因科技股份有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886
代理公司: 上海德昭知识产权代理有限公司 31204 代理人: 郁旦蓉
地址: 中国台湾台北市大安*** 国省代码: 中国台湾;71
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摘要:
搜索关键词: 探针 转移性肿瘤 处理模块 侦测 测试样本 基因 样本 芯片 矩阵 基因结合 表现 辨识 预测
【权利要求书】:

1.一种方法用以产生复数候选探针用以辨识一个哺乳动物中特定疾病、失调或基因症状的至少一个原发位置,其特征在于,包含:

(a)通过侦测芯片从一个患有特定疾病、失调或基因病变的受试者的标准样本中产生复数基因的表现,其中所述标准样本被诊断患有具有至少一个已知原发位置的转移性癌症;

(b)通过处理模块比较所述复数基因的表现以产生比较结果;以及

(c)根据所述比较结果转化出一个包含所述复数候选探针的矩阵,其中所述复数候选探针可以结合至选自SEQ ID NO:1~695或SEQ ID NO:1~695的任一片段中的任一复数多核苷酸序列,

其中,所述侦测芯片与所述处理模块彼此电连接。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述复数候选探针的数量为大约650个。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述复数候选探针的数量为大约100个。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述复数候选探针的数量为大约50个。

5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述侦测芯片包含:微数组生物芯片、次世代定序仪、实时聚合酶链锁反应(Quantitative PCR)、磁珠系统。

6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述处理模块是中央处理器(CPU)。

7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述标准样本包含血液、血浆、血清、尿液、组织、细胞、器官、体液或上述任意的组合。

8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述特定疾病、失调或基因症状包含血液科恶性肿瘤或实质固体瘤。

9.如权利要求1所述的方法,其特征在于,其中所述复数候选探针的长度为至少20个核苷酸。

10.一种方法用以辨识一个哺乳动物中特定疾病、失调或基因症状的至少一个原发位置,其特征在于,包含:

(a’)分析:通过一个包含如权利要求1~4的任一项中所述复数候选探针的侦测芯片分析一个患有特定疾病、失调或基因病变的受试者的测试样本中矩阵的表现量,其中所述测试样本被诊断患有具有至少一个已知原发位置的转移性癌症,以及所述复数候选探针可以结合至如权利要求1~4的任一项中选自SEQ ID NO:1~695或SEQ ID NO:1~695的任一片段中的任一复数多核苷酸序列;以及

(b’)预测:通过处理模块并且依据所述矩阵的表现量预测所述测试样本的原发位置。

11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,其中所述测试样本包含血液、血浆、血清、尿液、组织、细胞、器官、体液或上述任意的组合。

12.一种系统用以辨识一个哺乳动物中特定疾病、失调或基因症状的至少一个原发位置,其特征在于,包含:

侦测芯片,其包含复数候选探针,其中所述复数候选探针可以结合至选自SEQ ID NO:1~695或SEQ IDNO:1~695的任一片段中的任一复数多核苷酸序列;以及

处理模块,其与所述侦测芯片电连接,其中所述侦测芯片分析一个患有特定疾病、失调或基因病变的受试者的测试样本中矩阵的表现量,并且所述处理模块并且依据所述矩阵的表现量预测所述测试样本的原发位置。

13.如权利要求12所述的系统,其特征在于,其中所述复数候选探针的数量为大约650个。

14.如权利要求12所述的系统,其特征在于,其中所述复数候选探针的数量为大约100个。

15.如权利要求12所述的系统,其特征在于,其中所述复数候选探针的数量为大约50个。

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