[发明专利]用于微管蛋白β-3链(TUBB3)蛋白的SRM/MRM测定

权利要求书

1.福尔马林固定组织的人生物样品中人TUBB3蛋白水平的测量方法，包括使用质谱检测和/或定量从所述人生物样品制备的蛋白质消化物中TUBB3片段肽的量；并计算所述样品中TUBB3蛋白的水平；其中所述TUBB3片段肽是SEQ IDNO：1，并且其中所述水平是相对水平或绝对水平。

2.权利要求1的方法，还包括在检测和/或定量所述TUBB3片段肽的量之前分离所述蛋白质消化物的步骤。

3.权利要求1的方法，其中所述蛋白质消化物包含蛋白酶消化物。

4.权利要求1的方法，其中所述组织是石蜡包埋组织。

5.权利要求1的方法，其中所述组织获自肿瘤。

6.权利要求1的方法，还包括定量所述TUBB3片段肽。

7.权利要求6的方法，其中定量所述TUBB3片段肽包括将一种生物样品中所述TUBB3片段肽的量与其他独立生物样品中相同TUBB3片段肽的量进行比较。

8.权利要求7的方法，其中定量所述TUBB3片段肽包括通过与已知量的添加内标肽进行比较来确定生物样品中所述TUBB3片段肽的量，其中将生物样品中的所述TUBB3片段肽与具有相同氨基酸序列的内标肽进行比较，以及其中所述内标肽是同位素标记的肽。

9.权利要求1的方法，其中检测和/或定量蛋白质消化物中所述TUBB3片段肽的量指示了存在修饰的或未修饰的TUBB3蛋白以及与受试者体内癌症的关联。

10.权利要求9的方法，还包括将所述检测和/或定量所述TUBB3片段肽的量的结果或所述TUBB3蛋白的水平与癌症的诊断阶段/等级/状态相关联。

11.权利要求10的方法，其中所述将所述检测和/或定量所述TUBB3片段肽的量的结果或所述TUBB3蛋白的水平与癌症的诊断阶段/等级/状态相关联与以多重形式检测和/或定量其他蛋白质或来自其他蛋白质的肽的量相结合，以提供关于癌症的诊断阶段/等级/状态的额外信息。

12.权利要求1的方法，还包括向所述生物样品获自其的患者施用治疗有效量的癌症治疗剂，其中所述治疗剂和/或治疗剂的施用量基于所述TUBB3片段肽的量或TUBB3蛋白的水平。

13.权利要求1的方法，其中治疗剂结合TUBB3蛋白和/或抑制其生物活性。

14.治疗患有癌症的患者的方法，包括：

(a)定量从所述患者获得的肿瘤样品制备的蛋白质消化物中特定TUBB3片段肽的水平，并且使用质谱通过选择反应监测计算所述样品中TUBB3肽的水平；

(b)将所述TUBB3片段肽的水平与参考水平进行比较，和

(c)当TUBB3片段肽的水平低于所述参考水平时，用基于紫杉烷的化疗方案治疗患者，或者

(d)当TUBB3片段肽的水平高于所述参考水平时，用不含有效量紫杉烷的治疗方案治疗患者。

15.权利要求14的方法，其中所述参考水平为700amol/μg+/-250amol/μg的被分析的生物样品蛋白。

16.权利要求14的方法，其中所述参考水平为700amol/μg+/-150amol/μg的被分析的生物样品蛋白。

17.权利要求14的方法，其中所述参考水平为700amol/μg+/-100amol/μg的被分析的生物样品蛋白。