[发明专利]无加帽步骤的硫醇化寡核苷酸的合成有效

专利信息
申请号: 201780051170.4 申请日: 2017-06-22
公开(公告)号: CN109689668B 公开(公告)日: 2023-02-17
发明(设计)人: 石向林;杨纪民;W·F·吉斯曼;Y·费尔伦 申请(专利权)人: 比奥根MA公司
主分类号: C07H1/00 分类号: C07H1/00;C07H21/00
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 陈文平;黄海波
地址: 美国马*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 无加帽 步骤 硫醇 寡核苷酸 合成
【权利要求书】:

1.一种用于制备寡核苷酸的方法,所述方法包括:

a)使式(I)化合物:

与式(II)化合物:反应,以形成式(III)化合物:以及

b)用硫化剂使所述式(III)化合物硫化以形成式(IV)化合物:

以及由未反应的式(I)化合物形成式(V)化合物:

其中

每个R1和R11独立地是核碱基,其中所述核碱基的NH2如果存在的话,受胺保护基团保护;

每个R2和R12独立地选自由以下组成的组:H、卤代和任选地被C1-6烷氧基取代的C1-6烷氧基;

R3是任选地包含接头的固体载体;

Y不存在、是核苷酸或是包含2个或更多个核苷酸的寡核苷酸;

每个R4独立地是H或与R2的烷氧基形成环;

每个R14独立地是H或与R12的烷氧基形成环;

R15是羟基保护基团;

R16是任选地被-CN取代的C1-6烷基;

R17a和R17b独立地是C1-6烷基;

其中(i)所述硫化剂是3-氨基-1,2,4-二噻唑-5-硫酮且RS是–C(SH)(=N)-CN;(ii)所述硫化剂是苯乙酰二硫化物且RS是-C(=O)CH2C6H5;(iii)所述硫化剂是3-(二甲基氨基-亚甲基)氨基)-3H-1,2,4-二噻唑且RS是-C(=S)NHC(=S)N=CHN(CH3)2;(iv)所述硫化剂是3H-1,2-苯并二硫醇-3-酮1,1-二氧化物且RS是并且

其中所述式(I)化合物、所述式(II)化合物、所述式(III)化合物、所述式(IV)化合物和所述式(V)化合物任选地呈药学上可接受的盐的形式;

其限制条件是不需要加帽步骤。

2.如权利要求1所述的方法,其还包括以下步骤:c)使所述式(IV)化合物脱保护以形成式(VI)化合物:

或其药学上可接受的盐。

3.如权利要求2所述的化合物,其还包括以下步骤:d)使所述式(VI)化合物与式(II)化合物反应以形成式(VII)化合物:

或其药学上可接受的盐;以及

e)用氧化剂使所述式(VII)化合物氧化以形成式(VIII)化合物:

4.如权利要求3所述的方法,其还包括以下步骤:f)使所述式(VIII)化合物脱保护以形成式(IX)化合物:

或其药学上可接受的盐。

5.如权利要求4所述的方法,其中以所述式(VI)化合物或所述式(IX)化合物开始,重复步骤a)、b)和c)n次并且重复步骤d)、e)和f)m次,其中步骤a)、b)和c)以及步骤d)、e)和f)的重复可相对于彼此以任何顺序发生,其中n是至少1并且m是0、1、2、3或4;以形成式(X)或(XI)的寡核苷酸:

或其药学上可接受的盐;或者形成寡核苷酸,其中步骤a、b和c或步骤d、e和f的每次重复产生一些未反应的式(VI)或(IX)化合物,所述未反应的式(VI)或(IX)化合物在所述硫化步骤后与过量的硫化剂或所述硫化剂的所述副产物反应以形成式(XII)或(XIII)化合物:

其中每个X独立地选自S或O,其限制条件是在所述式(X)、(XI)、(XII)或(XIII)化合物中,X仅4、3、2、1或0次为O。

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