[发明专利]单链RNA-编辑寡核苷酸在审

专利信息
申请号: 201780039097.9 申请日: 2017-06-22
公开(公告)号: CN109477103A 公开(公告)日: 2019-03-15
发明(设计)人: J·J·图鲁宁;P·G·德布鲁因;B·克莱恩;R·S·雷迪斯;L·范辛特菲特 申请(专利权)人: ProQR治疗上市公司Ⅱ
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11
代理公司: 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 代理人: 龙淳;李巍
地址: 荷兰*** 国省代码: 荷兰;NL
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摘要:
搜索关键词: 寡核苷酸 核苷酸 腺苷 反义寡核苷酸 发夹 茎环结构 真核细胞 单链RNA 位置处 互补性
【权利要求书】:

1.一种反义寡核苷酸(AON),其能够在细胞中与目标RNA形成双链复合物,用于通过细胞中存在的ADAR酶对目标RNA中存在的目标腺苷进行脱氨基化,其中:

a)所述AON与包括目标腺苷的目标RNA区域互补,并且所述AON任选地包括相对于互补的目标RNA区域的一个或多个错配、摆动和/或凸起;

b)所述AON包括一个或多个具有一个或多个糖修饰的核苷酸,其条件是与目标腺苷相对的核苷酸包括具有2′-OH基团的核糖或者具有2′-H基团的脱氧核糖;

c)所述AON不包括能够形成具有结合ADAR酶能力的分子内茎环结构的部分;

d)所述AON不包括5′-端O6-苄基鸟嘌呤修饰;

e)所述AON不包括5′-端氨基修饰;并且

f)所述AON不与SNAP-标记结构域共价连接。

2.一种AON,其能够在细胞中与目标RNA形成双链复合物,用于通过细胞中存在的ADAR酶对目标RNA中存在的目标腺苷进行脱氨基化,其中:

a)所述AON与包括目标腺苷的目标RNA区域互补,并且所述AON任选地包括相对于互补的目标RNA区域的一个或多个错配、摆动和/或凸起;

b)所述AON包括一个或多个具有一个或多个糖修饰的核苷酸,其条件是与目标腺苷相对的核苷酸包括具有2′-OH基团的核糖或者具有2′-H基团的脱氧核糖;

c)所述AON不包括能够形成具有结合ADAR酶能力的分子内茎环结构的部分;并且

d)所述AON不是17-聚体或20-聚体。

3.一种AON,其能够在细胞中与目标RNA形成双链复合物,用于通过细胞中存在的ADAR酶对目标RNA中存在的目标腺苷进行脱氨基化,其中:

a)所述AON与包括目标腺苷的目标RNA区域互补,并且所述AON任选地包括相对于互补的目标RNA区域的一个或多个错配、摆动和/或凸起;

b)所述AON包括一个或多个具有一个或多个糖修饰的核苷酸,其条件是与目标腺苷相对的核苷酸包括具有2′-OH基团的核糖或者具有2′-H基团的脱氧核糖;

c)所述AON不包括能够形成具有结合ADAR酶能力的分子内茎环结构的部分;并且

d)所述AON的长度大于17个核苷酸,或者小于14个核苷酸。

4.一种AON,其能够在细胞中与目标RNA形成双链复合物,用于通过细胞中存在的ADAR酶对目标RNA中存在的目标腺苷进行脱氨基化,其中:

a)所述AON与包括目标腺苷的目标RNA区域互补;

b)所述AON包括一个或多个具有一个或多个糖修饰的核苷酸,其条件是与目标腺苷相对的核苷酸包括具有2′-OH基团的核糖或者具有2′-H基团的脱氧核糖;

c)所述AON不包括能够形成具有结合ADAR酶能力的分子内茎环结构的部分;并且

d)所述AON任选地包括相对于互补的目标RNA区域的1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个错配、摆动和/或凸起。

5.根据权利要求1-4中任一项所述的AON,其中与目标腺苷相对的核苷酸是胞苷、脱氧胞苷、尿苷或脱氧尿苷。

6.根据权利要求1-5中任一项所述的AON,其中从与目标腺苷相对的核苷酸直接地5′和/或3′的核苷酸包括具有2′-OH基团的核糖或者具有2′-H基团的脱氧核糖。

7.根据权利要求5或6所述的AON,其中所述AON中的所有其他核苷酸包括2′-O-烷基,优选2′-O-甲基。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的AON,包括至少一个硫代磷酸酯键。

9.根据权利要求8所述的AON,其中所述AON的5′和3′端的2、3、4、5或6个端部核苷酸以硫代磷酸酯键连接。

10.根据权利要求9所述的AON,其中5′和3′端处的端部5个核苷酸以硫代磷酸酯键连接。

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