[发明专利]用于检测阴道毛滴虫的组合物和方法

说明书

描述了用于快速检测生物样品或非生物样品中阴道毛滴虫(TV)的存在或不存在的方法。所述方法可以包括进行扩增步骤、杂交步骤和检测步骤。此外，提供了设计用于检测TV的靶向靶TV基因的引物、探针，以及试剂盒。

发明领域

本公开内容涉及分子诊断学领域，并且更具体地涉及阴道毛滴虫（Trichomonas vaginalis）的检测。

发明背景

阴道毛滴虫（TV）是一种引起滴虫病的有鞭毛的原生动物寄生虫，滴虫病是美国最普遍的非病毒的性传播感染，在全国影响约370万人。黑人和非西班牙裔白人女性之间的患病率不同，分别有13％和1.8％受影响。已经报道阴道毛滴虫感染影响 11％的年龄≥ 40岁的女性，并且已经报道患病率在STD诊所中测试的有症状的女性中高达26％，而在无症状女性中为6.5％。还已知阴道毛滴虫在与女性发生性关系的男性（MSW）中引起尿道炎。大多数感染都没有被注意到，70％的男性和85％的女性只经历轻微的症状，并且如果不治疗可能持续数月或数年。感染的无症状传播确实发生并且仍然是一个问题。女性中的感染包括阴道炎、宫颈炎和尿道炎。有症状的女性通常主诉阴道分泌物、外阴阴道疼痛和/或刺激。排尿困难也是常见的。并发症可能包括早产、低出生体重的后代、胎膜早破，以及流产后或子宫切除术后感染。已经报道了盆腔炎性疾病（PID）、输卵管性不孕和宫颈癌与先前滴虫病发作的关联。男性中的症状可能包括尿道炎、附睾炎或前列腺炎。

阴道毛滴虫感染与孕妇中HIV感染、早产和其它不良妊娠结局的风险增加到2到3倍相关。在具有HIV感染的女性中，阴道毛滴虫感染与盆腔炎性疾病（PID）的风险增加相关。由于与无症状滴虫病和HIV感染相关的不良事件，推荐对具有HIV感染的无症状女性进行阴道毛滴虫的常规筛查。阴道毛滴虫的诊断测试应该在寻求阴道分泌物处理的女性中进行。对于在高患病率环境（例如STD诊所和监狱）中接受处理的人以及对于处于感染高风险的无症状的人（例如具有多个性伴侣、非法使用毒品或有STD史的人），可考虑进行筛查。

在可获得分子方法之前，培养被认为是用于诊断阴道毛滴虫感染的金标准方法，但与分子方法相比时，已经估计培养的灵敏度在38％至82％的范围。对于女性中的培养，阴道分泌物相对于尿是优选的，因为尿培养已被显示不太灵敏。在男性中，培养标本需要尿道拭子、尿沉渣和/或精液。用于接种单一培养物的来自男性的多个标本的培养可以改进灵敏度。由于方便和相对低成本，生殖器分泌物的湿制备物的显微镜检查可能是用于阴道毛滴虫诊断的最常用方法，但与培养相比仅35％至80％灵敏。此外，湿涂片方法的灵敏度高度依赖于显微镜技术人员的经验以及标本运输到实验室的时间，其中在收集后1小时内灵敏度下降高达20％。因此，本领域需要一种以灵敏的方式特异性检测TV的快速且可靠的方法。

发明概述

本公开内容中的某些实施方案涉及用于快速检测生物样品或非生物样品中TV的存在或不存在的方法，例如通过在单个试管中的实时聚合酶链反应多路检测TV。实施方案包括检测TV的方法，其包括进行至少一个循环步骤，所述循环步骤可以包括扩增步骤和杂交步骤。此外，实施方案包括设计用于在单个管中检测TV的引物、探针和试剂盒。检测方法被设计用于靶向阴道毛滴虫基因组中的特定基因，所述方法具有区分最接近的相邻物种Trichomonas tenax和人五毛滴虫（Pentatrichomonas hominis）的潜力。