[发明专利]用于表征与口相关病症的方法和系统

说明书

用于针对使用者表征与口相关病症的系统和方法的实施方案可以包括如下中的一项或更多项：处理网络，所述处理网络能够操作以收集含有来自使用者集合的物质的容器，所述处理网络包括能够操作以通过对物质进行测序来确定微生物序列的测序系统；微生物群系表征系统，所述微生物群系表征系统能够操作以基于微生物序列确定微生物群系组成数据集和微生物群系功能多样性数据集，收集与所述使用者集合的与口相关病症相关联的补充数据集；并将补充数据和从微生物群系组成数据和微生物群系功能多样性数据提取的特征转化成与口相关病症的表征模型；和/或治疗系统，基于使用表征模型针对与口相关病症对使用者进行表征，所述治疗系统能够操作以促进对使用者的治疗。

相关申请的交叉引用

本申请是于2016年4月13日提交的美国专利申请No.15/097,862的部分接续申请，其要求于2015年4月13日提交的序列号为62/146,810的美国临时申请、于2015年4月13日提交的序列号为62/146,833的美国临时申请、于2015年4月14日提交的序列号为62/147,124的美国临时申请、于2015年4月13日提交的序列号62/146,852的美国临时申请、于2015年4月14日提交的序列号为62/147,058的美国临时申请、于2015年4月14日提交的序列号为62/147,077的美国临时申请、于2015年4月14日提交的序列号为62/147,315的美国临时申请以及于2015年4月14日提交的序列号为62/147,337的美国临时申请的权益，这些美国临时申请分别通过引用整体并入本文。

本申请还要求于2016年3月7日提交的序列号为62/304,642的美国临时申请和于2016年3月7日提交的序列号为62/304,645的美国临时申请的权益，这些美国临时申请各自通过引用整体并入本文。

技术领域

本发明总体上涉及微生物学领域，更具体地涉及微生物学领域中用于表征与口相关病症的新的且有用的方法和系统。

背景技术

微生物群系是与生物体相关的共栖、共生和致病微生物的生态群落。人类微生物群系包括与人类细胞相比多出超过10倍的微生物细胞，但由于样品处理技术、遗传分析技术以及用于处理大量数据的资源方面的局限性，对人类微生物群系的表征仍处于初期阶段。尽管如此，微生物群系被怀疑在许多与健康/疾病相关的状态(例如，准备分娩、糖尿病、自身免疫障碍、胃肠障碍、类风湿性障碍、神经障碍等)中起着至少部分作用。考虑到微生物群系在影响受试者的健康方面的深刻影响，应付出与微生物群系的表征、由该表征形成见解以及生成被配置为从生态失调状态恢复的疗法相关的努力。然而，目前用于分析人类微生物群系和基于所获见解提供治疗措施的方法和系统仍然遗留许多尚未被解答的问题。特别是，由于当前技术的局限性，基于微生物群系组成特征和/或功能特征来表征某些健康状况的方法以及针对具体受试者进行适应性调整的治疗(例如，益生菌治疗)尚不可行。

因此，在微生物学领域，需要一种用于以个体化和群体范围的方式表征健康状况的新的且有用的方法和系统。本发明提供了这样一种新的且有用的方法和系统。

附图说明

图1A-1B是用于微生物群系表征的方法的实施方案变型的示意性流程图；

图2描绘了用于微生物群系表征的系统和方法的实施方案变型；

图3描绘了在用于微生物群系表征的方法的实施方案中生成和应用表征模型的变型的示意图；

图4描绘了在用于微生物群系表征的方法的实施方案中应用和更新表征模型及治疗模型的变型；

图5描绘了在用于微生物群系表征的方法的实施方案中应用多个表征模型的变型；

图6描绘了在用于微生物群系表征的方法的实施方案中促进远程医疗治疗的变型；

图7描绘了基于益生菌的疗法在用于微生物群系表征的方法的实施方案中操作的机制的变型；