[发明专利]用于微生物多样性研究的引物组、接头组和测序方法有效
申请号: | 201711457924.4 | 申请日: | 2017-12-28 |
公开(公告)号: | CN107904297B | 公开(公告)日: | 2020-09-04 |
发明(设计)人: | 陈俊如;叶雷;袁丽娜;凡丽娜 | 申请(专利权)人: | 苏州协云基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) 11277 | 代理人: | 刘新宇;李茂家 |
地址: | 215123 江苏省苏州*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 微生物 多样性 研究 引物 接头 方法 | ||
1.一种用于针对微生物16S rRNA基因测序的引物组,其包含第一引物和第二引物,所述第一引物为如SEQ ID NO:1所示的序列,所述第二引物为如SEQ ID NO:4所示的序列。
2.根据权利要求1所述的引物组,其还包含第三引物和第四引物,所述第三引物为如SEQ ID NO:2所示的序列,所述第四引物为如SEQ ID NO:3所示的序列。
3.一种用于针对微生物16S rRNA测序扩增的接头组,所述接头组包含第一接头,所述第一接头为如SEQ ID NO:5所示的序列。
4.根据权利要求3所述的接头组,其还包含第二接头,所述第二接头为如SEQ ID NO:6所示的序列。
5.一种用于微生物多样性研究的测序方法,其特征在于,所述测序方法使用如权利要求1-2任一项所述的引物组和权利要求3-4任一项所述的接头组,进行测序;其中,所述测序方法包括使用测序平台测序的步骤,所述测序平台为Nextseq测序平台或HiseqX测序平台。
6.根据权利要求5所述的测序方法,其包括如下步骤:
(1)构建待测微生物的DNA文库:利用权利要求3-4任一项所述的接头组作为扩增引物,扩增待测微生物的DNA文库;
(2)确认步骤(1)得到的DNA文库的质量,并测定所述DNA文库的浓度;
(3)测序平台测序:将权利要求1-2任一项所述的引物组作为扩增引物,通过测序仪测序。
7.根据权利要求6所述的测序方法,其还包括如下步骤:
(4)确认测序结果的质量水平。
8.根据权利要求6-7任一项所述的测序方法,其特征在于,所述待测微生物为肠道微生物或环境微生物。
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