[发明专利]提取鱼类肌肉组织基因组DNA的方法在审
申请号: | 201711446034.3 | 申请日: | 2017-12-27 |
公开(公告)号: | CN108048452A | 公开(公告)日: | 2018-05-18 |
发明(设计)人: | 郑洪坤;郑建坡;刘东源;刘慧 | 申请(专利权)人: | 北京百迈客生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君;姚自奇 |
地址: | 101300 北京市顺义区南*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 提取 鱼类 肌肉 组织 基因组 dna 方法 | ||
1.一种提取鱼类肌肉组织基因组DNA的方法,其特征在于,
包括以下步骤:
(一)将鱼类肌肉组织在液氮预冷的研钵中研磨成粗粉,加入核提取液进行核提取,用孔径为80-100μm的过滤网过滤核提取液,将滤液在2-4℃离心机中,600g-650g离心10-15min,弃掉上清,收集沉淀;
(二)用核提取液重悬步骤(一)获得的沉淀,再用孔径为20-40μm的过滤网过滤重悬液,滤液部分在2-4℃离心机中,50g-60g离心1-2min,收集上清,再将上清液在2-4℃离心机中,600g-650g离心10-15min,弃掉上清,用核提取液重悬沉淀,最后将重悬液加到percoll细胞分离混合溶液上方,2-4℃离心机中,600g-650g离心30-50min后将中间层及中间层下方1-2mL液体吸出获得核液;
(三)用核提取液和0.5-1xPBS溶液重悬步骤(二)所得核液后,离心去除percoll细胞分离混合溶液并收集沉淀,将沉淀用CSB溶液重悬并在43-45℃水浴3.5-4.5min后与琼脂糖液混匀制胶块;
其中,所述percoll细胞分离混合溶液的组成成分包括20-30%(体积)的核提取液和70-80%(体积)的percoll细胞分离液。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(二)中相对于每毫升的所述滤液部分,percoll细胞分离混合溶液的用量为1-1.5mL。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,以g/mL计,步骤(一)中鱼类肌肉组织与核提取液按照1:8-10的质量体积比混合。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤(三)中所述CSB溶液的组成成分为:10mM-15mM Tris-HCL,10mM-25mM EDTA。
5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述核提取液的组成成分包括:10mM-15mM Tris-HCL,10mM-25mM EDTA,50mM-80mM氯化钾,0.5M-1.5M蔗糖,0.5mM-1.5mM精胺,0.5mM-1.5mM亚精胺,0.25-0.5%(体积)TritonX-100,2.5-7.5%(体积)β-巯基乙醇和8-10%(w/v)PVP10。
6.根据权利要求1-5任一项所述的方法,其特征在于,步骤(一)还包括,将鱼类肌肉组织研磨成粗粉后加入到装有核提取液的烧杯中,搅拌15-20min,直到看不到组织样。
7.根据权利要求1-6任一项所述的方法,其特征在于,所述方法还包括先利用蛋白酶k溶液和RNA酶溶液对胶块进行孵育,再用Wash Buffer和TE溶液对胶块进行清洗获得清洗后胶块,用溶胶酶溶解胶块后透析获得鱼类肌肉组织基因组DNA。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述蛋白酶K溶液的组成成分包括:0.8-1.5mg/mL蛋白酶K、93%-99%(体积)的Lysis buffer;和/或,所述Wash Buffer溶液的组成成分包括:10mM-15mM Tris-HCL,50mM-80mM EDTA 。
9.根据权利要求1-6任一项所述的方法,其特征在于,所述方法还包括以下步骤:
(四)48-52℃下用5-25倍体积的蛋白酶k溶液浸没胶块孵育1.5-2.5h后在15-25℃下静置4-6分钟,静置结束后去除液体组分,再用5-25倍体积的蛋白酶K溶液孵育12-24h,结束后在15-25℃下静置4-6分钟获得蛋白酶k孵育后胶块;
(五)将所述蛋白酶k孵育后胶块在RNA酶溶液中孵育去除RNA获得RNA酶孵育后胶块。
10.根据权利要求1-9任一项所述的方法,其特征在于,所述鱼为金鲳鱼。
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