[发明专利]饲料中沙门氏菌的微滴数字PCR检测方法在审
申请号: | 201711383009.5 | 申请日: | 2017-12-20 |
公开(公告)号: | CN108048585A | 公开(公告)日: | 2018-05-18 |
发明(设计)人: | 王准;聂丹丹;李文君;杨帆;王玮琳;李忠起;彭勃;罗雁非;刘金华;刘韬 | 申请(专利权)人: | 吉林出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/42 |
代理公司: | 长春市东师专利事务所 22202 | 代理人: | 张铁生 |
地址: | 130062 吉林*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 饲料 沙门氏菌 数字 pcr 检测 方法 | ||
1.饲料中沙门氏菌的微滴数字PCR检测方法,它包括如下步骤:
1)称取25g沙门氏菌样品至盛有225mL无菌培养液的均质袋中,用拍击式均质器拍打,稀释为1:10的样品匀液;沙门氏菌样品的增菌培养按照GB 4789.4进行;非目标菌株增菌采用LB培养液在36℃下培养20-30h;获得样品及对照组的增菌液;
2)提取待测样品、阳性对照、阴性对照的DNA;
3)获得鉴定沙门氏菌的PCR扩增引物及探针引物;
4)将步骤2)所得DNA进行微滴数字PCR扩增,获得反应液;所述的微滴数字PCR反应体系为20μL,各成分含量为:2×ddPCR 预混液10μL,上下游引物(10 µmol/L)各1μL,探针引物(10 µmol/L)1μL,模板DNA 4μL,双蒸水3μL;反应条件为:95℃/5min,1个循环;95℃/15s,60℃/1min,40个循环;98℃/10min(1℃/s),12℃保存反应产物;体系完成后,进行数字PCR反应;
5)对步骤4)的反应液进行检测与分析。
2.根据权利要求1所述的饲料中沙门氏菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于:步骤3)中所述的鉴定沙门氏菌的PCR扩增引物及探针引物,包括:沙门氏菌引物正向序列:5'-GCGGCGTTGGAGAGTGATA-3',反向序列;5'-AGCAATGGAAAAAGCAGGATG-3';探针序列:5'-FAM-CATTTCTTAAACGGCGGTGTCTTTCCCT-TAMRA-3'。
3. 根据权利要求1所述的饲料中沙门氏菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于:步骤1)中所述的非目标菌株为:产气荚膜梭菌(ATCC 13124)、粪链球菌(ATCC29212)、金黄色葡萄球菌(ATCC26001)、肠出血性大肠艾希氏菌O157:H7(JL08038)、单核细胞增生李斯特菌(ATCC19111);培养时间为24h。
4. 根据权利要求2或3所述的饲料中沙门氏菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于:步骤2)中所述的提取,具体包括以下步骤:取增菌液,8000r/min离心5min,弃上清液,加入500μL CTAB、40μL蛋白酶K,震荡均匀,65℃温浴30min;加入500μL三氯甲烷:异戊醇(24∶1),震荡,12000 r/ min 离心15 min;吸取上层水相至1.5mL离心管中,加入等体积的异丙醇,震荡均匀,12000r/min离心10 min;弃上清液,用预热至65℃ TE缓冲液溶解DNA;加入5μLRNA酶溶液,37℃温浴30 min;加入200μL三氯甲烷:异戊醇(24∶1),震荡,12000r/min离心15min;吸取上层水相至新的1.5mL离心管中,加入等体积的异丙醇,震荡均匀,12000r/min离心10 min;弃上清液,加入70%乙醇洗涤沉淀DNA,12000r/min离心1 min;弃上清液,干燥,加50μL预热至65℃ TE缓冲液溶解DNA。
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