[发明专利]拆分型单碱基基因编辑系统及其应用有效
申请号: | 201711368309.6 | 申请日: | 2017-12-18 |
公开(公告)号: | CN109929839B | 公开(公告)日: | 2021-02-12 |
发明(设计)人: | 李大力;张晓辉;刘明耀 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学;上海邦耀生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/864 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 徐迅;王正君 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 拆分 碱基 基因 编辑 系统 及其 应用 | ||
1.一种核酸构建物组合,其特征在于,包括第一核酸构建物和第二核酸构建物,其中,所述第一核酸构建物具有从5’-3’的式I结构:
P1-X1-X2-X3-Z-X4 (I);
其中,P1为第一启动子序列;
X1为胞嘧啶脱氨酶Apobec1的编码序列;
X2为任选的连接序列;
X3为Cas9核酸酶的N端片段的编码序列或KKH核酸酶的N端片段的编码序列;
Z为第一融合肽N端片段的编码序列;
X4为polyA序列;
所述第二核酸构建物具有从5’-3’的式II结构:
P2-Z-Y1-Y2-Y3 (II);
其中,P2为第二启动子序列;
Z为第一融合肽C端片段的编码序列;
Y1为Cas9核酸酶的C端片段的编码序列或KKH核酸酶的C端片段的编码序列;
Y2为尿嘧啶糖苷酶抑制剂UGI的编码序列;
Y3为polyA序列;
并且,各“-”独立地为键或核苷酸连接序列;
所述的第一启动子和第二启动子各自独立地选自下组:CAG启动子、CMV启动子、或其组合;
所述连接序列选自下组:XTEN、GGS、(GGS)3、(GGS)7、或其组合;
所述Cas9核酸酶的N端片段为登录号为2828055的Cas9n核酸酶的2-573位氨基酸;
所述Cas9核酸酶的C端片段为登录号为2828055Cas9n核酸酶的574-1368位氨基酸;
所述KKH的N端片段为登录号为2828033的KKH核酸酶的2-739位氨基酸;
所述KKH的C端片段为登录号为2828033的KKH核酸酶的740-1053位氨基酸;
所述的第一融合肽为内含肽Intein;并且所述第一融合肽N端片段为内含肽Intein的2-103位氨基酸;所述第一融合肽C端片段为内含肽Intein的104-137位氨基酸;
所述polyA序列各自独立地选自下组:BGH的polyA、SV40的polyA、或其组合;
并且当所述第一核酸构建物中的X3为Cas9核酸酶的N端片段的编码序列时,则所述第二核酸构建物中的Y1为Cas9核酸酶的C端片段的编码序列;当所述第一核酸构建物中的X3为KKH核酸酶的N端片段的编码序列时,则所述第二核酸构建物中的Y1为KKH核酸酶的C端片段的编码序列。
2.如权利要求1所述的核酸构建物组合,其特征在于,所述的第一启动子和第二启动子各自独立地为CAG启动子。
3.如权利要求1所述的核酸构建物组合,其特征在于,所述连接序列为XTEN。
4.如权利要求1所述的核酸构建物组合,其特征的在于,所述X3元件的来源选自下组:酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)、葡萄球菌(
5.如权利要求1所述的核酸构建物组合,其特征在于,所述第一核酸构建物的长度≤4.7kb。
6.如权利要求5所述的核酸构建物组合,其特征在于,所述第一核酸构建物的长度≤4.5kb。
7.如权利要求6所述的核酸构建物组合,其特征在于,所述第一核酸构建物的长度为3.0-4.5kb。
8.如权利要求1所述的核酸构建物组合,其特征在于,所述第二核酸构建物的长度≤4.7kb。
9.如权利要求8所述的核酸构建物的组合,其特征在于,所述第二核酸构建物的长度≤4.5kb。
10.如权利要求9所述的核酸构建物的组合,其特征在于,所述第二核酸构建物的长度为3.0-4.5kb。
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