[发明专利]缢蛏I型溶菌酶-2基因、编码蛋白及重组缢蛏I型溶菌酶-2基因工程菌的构建方法有效
| 申请号: | 201711363480.8 | 申请日: | 2017-12-18 |
| 公开(公告)号: | CN108048475B | 公开(公告)日: | 2021-03-23 |
| 发明(设计)人: | 李成华;邵铱娜;张卫卫;赵雪琳 | 申请(专利权)人: | 宁波大学 |
| 主分类号: | C12N15/56 | 分类号: | C12N15/56;C12N15/10;C12N9/36;C12N15/70;C12N15/66;A61K38/47;A61P31/04 |
| 代理公司: | 宁波奥圣专利代理有限公司 33226 | 代理人: | 何仲 |
| 地址: | 315211 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 缢蛏 型溶菌酶 基因 编码 蛋白 重组 基因工程 构建 方法 | ||
1.一种缢蛏I型溶菌酶-2基因,其特征在于:该基因为SEQ ID NO.1所示的基因序列。
2.一种权利要求1所述的缢蛏I型溶菌酶-2基因的克隆方法,其特征在于:根据与I型溶菌酶-2基因同源的表达序列标签EST序列设计RACE的巢式引物,采用RACE技术扩增基因全长,具体步骤如下:
(1)通过对副溶血弧菌感染的缢蛏肝胰腺组织高通量转录组测序,发现了1条编码I型溶菌酶基因的EST序列,以此EST序列片段进行基因全长克隆;
(2)RACE引物设计:根据编码缢蛏I型溶菌酶-2基因的部分片段的EST克隆设计3’RACE的巢式引物:3’上游特异性扩增引物1:
CAGTTTCCTCCCGGACCTGTTGA,3’上游特异性扩增引物2:
GCCAGACGTACGCTAGGGAACAC,扩增3’接头引物Adaptor3:
GGCCACGCGTCGACTAGTACTT;
(3)3’RACE扩增获取缢蛏I型溶菌酶-2基因全长序列,具体步骤如下:
a.总RNA提取:取缢蛏的肝胰腺组织制备得到RNA提取液;
b.3’-RACE扩增:将上述RNA提取液用3’-Full RACE Core Set withPrimeScriptTMRTase试剂盒逆转录合成扩增3’的模板,以此为模板,使用3’上游特异性引物1和扩增3’接头引物进行PCR扩增,取稀释后PCR产物作为模板,再用3’上游特异性引物2和扩增3’接头引物进行PCR扩增,得到3’端目的条带;
c.将扩增产物3’端目的条带使用凝胶回收试剂盒回收,回收产物与载体pMD19-T连接,转化至大肠杆菌Escherichia coli DH5α后,在含有氨苄浓度为50μg/mL的LB平板培养基中培养8-12h,挑取阳性克隆菌落,进行PCR验证并送至上海华大基因生物工程有限公司测序,所得结果经DNAMAN软件分析拼接得到缢蛏I型溶菌酶-2基因全长序列,其基因序列如SEQID NO.1所示。
3.一种权利要求1或2所述的缢蛏I型溶菌酶-2基因编码蛋白,其特征在于:该编码蛋白为SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列。
4.根据权利要求3所述的一种缢蛏I型溶菌酶-2基因编码蛋白,其特征在于:该编码蛋白的成熟肽为SEQ ID NO.3所示的氨基酸序列。
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