[发明专利]环介导恒温扩增法检测苎麻疫霉菌的引物及其检测方法在审
申请号: | 201711363015.4 | 申请日: | 2017-12-18 |
公开(公告)号: | CN107881254A | 公开(公告)日: | 2018-04-06 |
发明(设计)人: | 兰成忠;游泳;阮宏椿;吴玮 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350013 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 环介导 恒温 扩增 检测 苎麻 霉菌 引物 及其 方法 | ||
1. 环介导恒温扩增法检测苎麻疫霉菌的引物,其特征在于,所述的引物由F3、B3、FIP和BIP 4条特异性引物组成,其核苷酸序列分别为:F3:5’- TTCCTTCCGTGTAGTCGGT -3’,B3: 5’- CCGAAACCAACACTACCGC -3’,FIP: 5’- ATTTCAAAGGACTCGCCGCCG-GGGAATGCCAGACGTGAAG -3’,BIP: 5’- ATGTATGTTGTGGAGGCTGCCA-CCTCTCCAAAACGCCTCAG - 3’。
2.利用权利要求1所述引物建立的苎麻疫霉菌环介导等温扩增检测的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)待测样品中基因组DNA的提取:用CTAB方法或DNA提取试剂盒提取待测样品中DNA;
(2)LAMP恒温扩增:以步骤(1)提取的DNA为模板,在PCR管中配制25μL反应体系,包括5 μM引物F3和B3各1.0 μL,40 μM引物FIP和BIP各1.0 μL,LAMP反应混合液12.5μL,8 U Bst聚合酶1.0 μL,模板DNA 1.0 μL,用灭菌超纯水补足至25μL,将配制好的PCR管置于63℃水浴锅中恒温反应60min;
(3)LAMP扩增结果的判断:待LAMP反应结束后,在反应产物中加入1μL SYBR Green I荧光显色剂轻轻混匀,静置5min进行显色观察,在常光下反应显现绿色,则待测样品中含有苎麻疫霉菌,反应显现橙色,则待测样品中不含有苎麻疫霉菌,在紫外光下若观察到浑浊状沉淀则样品中含有苎麻疫霉菌,澄清透明则样品中不含有苎麻疫霉菌。
3. 根据权利要求2所述的苎麻疫霉菌环介导恒温扩增检测的方法,其特征在于,LAMP反应混合液由如下成分组成:40 mM Tris-HCl,20 mM (NH4)2SO4,20 mM KCl,16 mM MgSO4,1.6 mol/L甜菜碱,2.0 mM dNTPs,0.2wt.% Trion X-100。
4.如权利要求1所述引物在检测苎麻疫霉菌中的应用。
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